More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1568 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  100 
 
 
323 aa  656    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  89.16 
 
 
323 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  61.61 
 
 
329 aa  420  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.11 
 
 
352 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.9 
 
 
354 aa  278  9e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  40.06 
 
 
386 aa  275  8e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  42.74 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.72 
 
 
345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  46 
 
 
344 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.14 
 
 
378 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  43.82 
 
 
356 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.58 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  42.57 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.99 
 
 
357 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  42.81 
 
 
342 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  43.05 
 
 
364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2481  ABC transporter, ATP-binding protein  45.89 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.01 
 
 
370 aa  268  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.01 
 
 
348 aa  267  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  44.82 
 
 
342 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.78 
 
 
353 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  40.38 
 
 
346 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  40.38 
 
 
346 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  40.38 
 
 
346 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.48 
 
 
352 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.17 
 
 
384 aa  265  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  40.95 
 
 
364 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 
353 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  40.12 
 
 
349 aa  264  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
353 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  39.71 
 
 
352 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  38.94 
 
 
350 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.88 
 
 
383 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.34 
 
 
362 aa  263  3e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 
349 aa  262  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  41.18 
 
 
353 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  42.35 
 
 
350 aa  262  6e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  46.1 
 
 
376 aa  262  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.52 
 
 
353 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2053  ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 
337 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.72 
 
 
382 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  39.81 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
353 aa  262  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.06 
 
 
363 aa  261  8e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 
348 aa  261  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 
331 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  40.18 
 
 
353 aa  261  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  43.62 
 
 
341 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  43.65 
 
 
352 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.05 
 
 
353 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  37.97 
 
 
352 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
365 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  37.97 
 
 
352 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  42.86 
 
 
344 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.41 
 
 
350 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0856  ABC transporter, ATP-binding protein  40.9 
 
 
337 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0425057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1901  ABC transporter, ATP-binding protein  40.9 
 
 
337 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  48.36 
 
 
353 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  39.14 
 
 
360 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  39.14 
 
 
360 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.38 
 
 
331 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  41.6 
 
 
356 aa  260  3e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.17 
 
 
423 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0897  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.9 
 
 
365 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2213  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.9 
 
 
365 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.73 
 
 
352 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  43.87 
 
 
353 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1759  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.9 
 
 
365 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354405  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0585  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components  40.6 
 
 
365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  44.91 
 
 
319 aa  259  6e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  40.24 
 
 
353 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.24 
 
 
358 aa  258  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  45.11 
 
 
348 aa  258  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  46.62 
 
 
349 aa  258  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 
353 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.79 
 
 
363 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 
366 aa  257  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  46.37 
 
 
333 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.1 
 
 
369 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.89 
 
 
377 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.73 
 
 
353 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.06 
 
 
373 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  41.82 
 
 
339 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 
351 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  39.36 
 
 
353 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 
333 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  40.61 
 
 
356 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  46.24 
 
 
349 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  41.85 
 
 
347 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  41.06 
 
 
351 aa  257  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  40.53 
 
 
353 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 
333 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  39.08 
 
 
353 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.67 
 
 
338 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  41.5 
 
 
363 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5066  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  40 
 
 
367 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478807  normal  0.674172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.32 
 
 
354 aa  256  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>