23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1485 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  59.48 
 
 		 271 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  34.48 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  33.21 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  32.58 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  26.67 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  28.73 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  29.23 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  28.9 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  30.67 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  28.07 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  27.37 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  28.23 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  28.83 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  26.1 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  26.35 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  29.46 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  29.33 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  25.19 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  26.95 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  23.22 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  22.81 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3080  hypothetical protein  40.96 
 
 		 157 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.178207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>