87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1443 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  94.74 
 
 
228 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  94.3 
 
 
228 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  67.98 
 
 
228 aa  333  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  53.74 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  32.37 
 
 
313 aa  89  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  28.05 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
336 aa  78.6  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
344 aa  78.6  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  32.46 
 
 
375 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
327 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 
348 aa  75.5  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 
366 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 
384 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  34.48 
 
 
321 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  32.95 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
371 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 
347 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
354 aa  62.4  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 
343 aa  62  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  30.41 
 
 
316 aa  61.6  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  31.79 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 
528 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 
531 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
315 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
534 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 
534 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  30.67 
 
 
328 aa  58.9  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 
361 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
343 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.98 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.33 
 
 
324 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.57 
 
 
376 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.98 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.98 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.98 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.98 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.98 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.98 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.98 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.4 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.98 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.74 
 
 
314 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 
377 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.35 
 
 
323 aa  55.1  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  32.35 
 
 
323 aa  55.1  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  26.27 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  28.03 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
170 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  27.21 
 
 
387 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  28.78 
 
 
314 aa  52  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  24.72 
 
 
375 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
504 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
524 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 
327 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  27.53 
 
 
326 aa  48.5  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.25 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  27.23 
 
 
325 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  30.83 
 
 
511 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.67 
 
 
313 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.67 
 
 
313 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2967  putative metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
196 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0221  hypothetical protein  27.78 
 
 
286 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  31.53 
 
 
507 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  31.53 
 
 
507 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  28.81 
 
 
512 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  25.81 
 
 
513 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  30.25 
 
 
487 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
518 aa  42.4  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0659  hypothetical protein  27.08 
 
 
289 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.418378 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
513 aa  42  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
512 aa  42  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>