155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1422 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  99.23 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  97.68 
 
 
259 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  90.35 
 
 
259 aa  475  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  71.01 
 
 
271 aa  353  2e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  60.42 
 
 
249 aa  296  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  59.17 
 
 
263 aa  291  6e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  59.24 
 
 
240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  59.65 
 
 
240 aa  278  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  57.14 
 
 
241 aa  272  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  58.77 
 
 
240 aa  270  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  57.33 
 
 
239 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  61.65 
 
 
272 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  54.75 
 
 
243 aa  248  6e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  50.22 
 
 
248 aa  246  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  53.33 
 
 
251 aa  244  9e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  54.35 
 
 
243 aa  244  9e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  50.83 
 
 
241 aa  241  7e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  49.8 
 
 
249 aa  239  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  51.49 
 
 
242 aa  237  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  50.85 
 
 
238 aa  236  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  50 
 
 
251 aa  232  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  51.07 
 
 
256 aa  231  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  51.69 
 
 
267 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  54.84 
 
 
271 aa  230  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  51.72 
 
 
247 aa  229  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  50.43 
 
 
245 aa  228  8e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  50.45 
 
 
241 aa  226  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  47.58 
 
 
240 aa  221  9e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  50.64 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  50.92 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  46.05 
 
 
268 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  44.07 
 
 
253 aa  204  9e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  45.74 
 
 
270 aa  199  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  43.16 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  42.11 
 
 
289 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  45.34 
 
 
245 aa  193  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  44.08 
 
 
250 aa  190  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  45.54 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  43.33 
 
 
257 aa  188  7e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  43.11 
 
 
246 aa  188  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  43.33 
 
 
258 aa  187  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  41.59 
 
 
240 aa  177  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  39.47 
 
 
285 aa  175  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  41.26 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  40.23 
 
 
264 aa  171  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  40.82 
 
 
250 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  41.12 
 
 
233 aa  166  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  41.01 
 
 
236 aa  159  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  41.84 
 
 
256 aa  158  7e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  41.91 
 
 
280 aa  158  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  45.2 
 
 
256 aa  153  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  37.5 
 
 
235 aa  153  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  37.21 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  36.84 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  40.2 
 
 
254 aa  142  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  39.21 
 
 
246 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  37.33 
 
 
299 aa  140  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  35.06 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  35.51 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  34.73 
 
 
278 aa  135  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  37.5 
 
 
298 aa  132  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  33.46 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  37.21 
 
 
269 aa  128  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  36.87 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  38.95 
 
 
299 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  34.09 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  30.17 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  34.95 
 
 
211 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  36.36 
 
 
180 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  35.55 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  35.48 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  32.52 
 
 
207 aa  108  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  35 
 
 
219 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  35 
 
 
219 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  35 
 
 
219 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  32.11 
 
 
238 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  35.32 
 
 
200 aa  106  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  33.33 
 
 
203 aa  102  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  34.84 
 
 
219 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  33.8 
 
 
236 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  31.84 
 
 
203 aa  99.4  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  31.86 
 
 
203 aa  99  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  36.47 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  30.57 
 
 
203 aa  94  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  35.98 
 
 
217 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.76 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  34.13 
 
 
211 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  32.29 
 
 
196 aa  89.4  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  34.21 
 
 
200 aa  89.4  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  31.07 
 
 
204 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  36.53 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  32.47 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  38.1 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  35.33 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  32.8 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  33.73 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  30.93 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  25.98 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.1 
 
 
210 aa  79  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>