More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1395 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  100 
 
 
153 aa  297  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  97.39 
 
 
153 aa  292  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  96.08 
 
 
153 aa  289  8e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  77.12 
 
 
153 aa  238  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  55.33 
 
 
155 aa  176  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  44.74 
 
 
158 aa  143  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  42 
 
 
154 aa  120  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  36.84 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  36.62 
 
 
161 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  34 
 
 
160 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  34.67 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  40.76 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  38.57 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  34.84 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  35.29 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  36.54 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  33.97 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  35.67 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  35.67 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.17 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  32.69 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.55 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  36.54 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  32.24 
 
 
230 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  32.05 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  36.36 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  33.55 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  36.36 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  34.19 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  33.55 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.86 
 
 
620 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 
242 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  33.12 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  33.11 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  33.12 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  31.85 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  34.19 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  35.95 
 
 
214 aa  73.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  34.03 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  32.91 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  35.33 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  33.56 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  33.55 
 
 
242 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  33.33 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  35.9 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  34.18 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  33.99 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  30.07 
 
 
216 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  30.92 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  35.22 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  30.72 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  32.9 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  33.77 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  32.24 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  33.12 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  31.03 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.19 
 
 
243 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 
246 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  34.21 
 
 
215 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  26.49 
 
 
258 aa  67.4  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32 
 
 
769 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  30.14 
 
 
688 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  34.03 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
688 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  28.39 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  34 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  30.07 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29.53 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.9 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.17 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  27.46 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.89 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  29.61 
 
 
226 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.82 
 
 
243 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.89 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  29.33 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.46 
 
 
201 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.23 
 
 
482 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  31.33 
 
 
201 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 
211 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  28.57 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  33.12 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 
688 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
246 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.88 
 
 
845 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.32 
 
 
232 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 
215 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  29.81 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  31.43 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 
283 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  30.56 
 
 
243 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  28.19 
 
 
217 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>