161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1245 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  100 
 
 		 171 aa  346  8e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  98.25 
 
 		 171 aa  342  2e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  97.08 
 
 		 171 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  80.7 
 
 		 171 aa  288  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  45.45 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  43.37 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.24 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  37.58 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  37.2 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  38.27 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  35.37 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  33.72 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  34.16 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  34.16 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  37.58 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  36.75 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.1 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  35.5 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.72 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.55 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  37.75 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  35.67 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.97 
 
 		 167 aa  97.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.75 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  34.03 
 
 		 163 aa  91.3  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  29.24 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  32.3 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.46 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  33.8 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  30.06 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.21 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30.25 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.65 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.56 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.26 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  30.71 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.36 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.49 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.76 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.84 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  30.63 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  32.08 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  29.81 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  29.81 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  30 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  30.97 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.41 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.87 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.79 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  32.87 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  26.9 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.67 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  34.53 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  32.03 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.17 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.14 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  31.43 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.09 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  31.43 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  28.99 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  24.22 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  27.38 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  30.43 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.84 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.34 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  30.5 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.32 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.54 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28.27 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  27.86 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.43 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  30.82 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.22 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.1 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  28.67 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  27.07 
 
 		 182 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  30.17 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  29.94 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  27.47 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.21 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  28.28 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.87 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  29.52 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  26.67 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  26.8 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.68 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  28.99 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.73 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.9 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  26.62 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.37 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  27.16 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.66 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  27.67 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>