More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1239 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  100 
 
 
285 aa  584  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  97.54 
 
 
285 aa  577  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  97.89 
 
 
285 aa  577  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  82.11 
 
 
285 aa  496  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  66.78 
 
 
284 aa  413  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  52.28 
 
 
285 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  51.92 
 
 
286 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  49.48 
 
 
285 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  49.31 
 
 
285 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  48.44 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  49.31 
 
 
285 aa  265  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  48.96 
 
 
285 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  48.96 
 
 
285 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  51.95 
 
 
286 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  48.96 
 
 
285 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  48.96 
 
 
285 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  48.96 
 
 
285 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  48.26 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  51.37 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  48.61 
 
 
306 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  51.39 
 
 
287 aa  261  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  47.92 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  47.92 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  47.92 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  47.92 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  47.92 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  47.92 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  47.92 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  47.75 
 
 
285 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  51.75 
 
 
295 aa  258  8e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  54.25 
 
 
281 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  50 
 
 
283 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  49.1 
 
 
279 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  46.81 
 
 
282 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  55.42 
 
 
283 aa  255  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  48.93 
 
 
282 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  49.81 
 
 
296 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  51.96 
 
 
283 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  46.88 
 
 
288 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  49.29 
 
 
279 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  48.26 
 
 
286 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  47.92 
 
 
286 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  47 
 
 
308 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  51.57 
 
 
285 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  46.48 
 
 
296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  50.78 
 
 
287 aa  245  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  49.3 
 
 
294 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  47.92 
 
 
286 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  47.57 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  45.07 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  50.99 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  53.17 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  50.88 
 
 
284 aa  242  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  48.11 
 
 
296 aa  241  7e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  51.79 
 
 
287 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  48.44 
 
 
297 aa  241  9e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  50.53 
 
 
284 aa  241  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  51.82 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  44.52 
 
 
316 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  50.81 
 
 
280 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  48.38 
 
 
280 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  49.8 
 
 
286 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  48.94 
 
 
285 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  43.71 
 
 
290 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  43.36 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  45.58 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  44.37 
 
 
307 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  50.4 
 
 
280 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  42.2 
 
 
320 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  46.88 
 
 
291 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  47.92 
 
 
294 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  45.32 
 
 
285 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  41.55 
 
 
320 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  49.8 
 
 
279 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  45.68 
 
 
293 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  44.88 
 
 
325 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  44.88 
 
 
325 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  44.52 
 
 
321 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  45.04 
 
 
280 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  45.88 
 
 
279 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  45.42 
 
 
292 aa  228  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  45.04 
 
 
280 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  47.74 
 
 
324 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  44.13 
 
 
315 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  43.31 
 
 
299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  43.62 
 
 
287 aa  225  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  43.46 
 
 
293 aa  224  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  41.9 
 
 
313 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  44.24 
 
 
317 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  43.46 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  45.95 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  45.52 
 
 
279 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  43.49 
 
 
287 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  42.81 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  43.9 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  43.11 
 
 
300 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  43.26 
 
 
310 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  44.24 
 
 
292 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  43.37 
 
 
286 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  46.22 
 
 
281 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>