217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1201 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  92.55 
 
 		 316 aa  490  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  87.45 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  67.84 
 
 		 316 aa  372  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  54.39 
 
 		 335 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  51.33 
 
 		 290 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  37.26 
 
 		 488 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  36.24 
 
 		 483 aa  155  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.02 
 
 		 486 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  38.53 
 
 		 494 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  37.2 
 
 		 489 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  35.85 
 
 		 486 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  37.56 
 
 		 490 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  35.81 
 
 		 483 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.84 
 
 		 502 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.93 
 
 		 483 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  36.74 
 
 		 528 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  35.71 
 
 		 495 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  35.51 
 
 		 490 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  34.91 
 
 		 486 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  32.88 
 
 		 486 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  36.89 
 
 		 496 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  34.58 
 
 		 499 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.07 
 
 		 492 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.04 
 
 		 499 aa  138  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  34.88 
 
 		 524 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  35.21 
 
 		 495 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  32.37 
 
 		 484 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  32.37 
 
 		 484 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  34.74 
 
 		 495 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  34.95 
 
 		 518 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  34.95 
 
 		 518 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  31.95 
 
 		 529 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  34.12 
 
 		 526 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.12 
 
 		 526 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.67 
 
 		 502 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  32.59 
 
 		 515 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  28.23 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.01 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  27.19 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.94 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  22.02 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.56 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.73 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.94 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.24 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  25.68 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.24 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  25.5 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.62 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.28 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  24.88 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  24.76 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  26.44 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  26.74 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.23 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.68 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.35 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  26.83 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.9 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.84 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.98 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  26.7 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  24.88 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.75 
 
 		 471 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  27.45 
 
 		 301 aa  52.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  23.95 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  22.07 
 
 		 301 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  26.79 
 
 		 308 aa  52  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  27.08 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  25.12 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.84 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.35 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  22.58 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.61 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  23.67 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.03 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.02 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.96 
 
 		 1496 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  25.35 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.31 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0657  RimK domain protein ATP-grasp  20.93 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  23.5 
 
 		 337 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  28.12 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  23.38 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  28.21 
 
 		 319 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  21.78 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  23.79 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  23.27 
 
 		 302 aa  48.9  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.04 
 
 		 301 aa  48.9  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  24.67 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  23.5 
 
 		 302 aa  48.5  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  22.9 
 
 		 456 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  26.67 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  22.97 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  22.48 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.03 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  26.53 
 
 		 337 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>