More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1171 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 
912 aa  1849    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  37.7 
 
 
945 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 
933 aa  403  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  32.48 
 
 
932 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  31.84 
 
 
932 aa  392  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  40.11 
 
 
1005 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  30.57 
 
 
936 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  30.44 
 
 
907 aa  373  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  29.44 
 
 
1137 aa  369  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  30.9 
 
 
1131 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  31.63 
 
 
936 aa  369  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  30.48 
 
 
1137 aa  358  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 
1137 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  30.34 
 
 
1137 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  30.43 
 
 
1133 aa  343  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  30.1 
 
 
1126 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3175  type III restriction protein res subunit  29.27 
 
 
1115 aa  340  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  29.73 
 
 
1138 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  30.12 
 
 
1137 aa  337  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  29.58 
 
 
1129 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  37.4 
 
 
1115 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  30.43 
 
 
1125 aa  322  1.9999999999999998e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  28.11 
 
 
1138 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  28.97 
 
 
1233 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  29.39 
 
 
1130 aa  313  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  33.58 
 
 
1108 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  29.6 
 
 
1141 aa  308  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  33.75 
 
 
1113 aa  301  5e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  29.85 
 
 
1119 aa  296  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3394  putative restriction modification enzyme R subunit protein  25.75 
 
 
954 aa  247  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  29.74 
 
 
753 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  30.6 
 
 
845 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.98 
 
 
1082 aa  185  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0129  type III restriction protein res subunit  28.44 
 
 
846 aa  180  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.042937  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  29.32 
 
 
780 aa  179  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.65 
 
 
1080 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  29.12 
 
 
790 aa  178  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.46 
 
 
1068 aa  178  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 
583 aa  178  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  26.06 
 
 
800 aa  177  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.79 
 
 
1068 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  29.2 
 
 
875 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  28.83 
 
 
787 aa  174  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  27.14 
 
 
899 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  29.25 
 
 
899 aa  172  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  29.47 
 
 
770 aa  171  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  28.57 
 
 
765 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  27.77 
 
 
787 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  31.1 
 
 
796 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.9 
 
 
1137 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  29.83 
 
 
776 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  28.94 
 
 
771 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  26.09 
 
 
791 aa  163  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.95 
 
 
1174 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  28.69 
 
 
797 aa  161  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  27.13 
 
 
783 aa  161  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  28.52 
 
 
811 aa  161  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  26.94 
 
 
815 aa  161  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  28.79 
 
 
784 aa  160  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  28.79 
 
 
784 aa  160  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  29.67 
 
 
809 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  27.22 
 
 
788 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.98 
 
 
1157 aa  159  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  27.53 
 
 
813 aa  159  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  27.37 
 
 
796 aa  158  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  26.78 
 
 
815 aa  158  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  27.55 
 
 
793 aa  157  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  29.75 
 
 
770 aa  157  9e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  27.99 
 
 
790 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.63 
 
 
1124 aa  157  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  29.45 
 
 
761 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  28.55 
 
 
760 aa  155  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  29.28 
 
 
810 aa  155  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  27.62 
 
 
791 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  28.21 
 
 
760 aa  153  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.87 
 
 
1167 aa  154  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  27.55 
 
 
783 aa  153  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  26.13 
 
 
893 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  28.47 
 
 
821 aa  153  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  27.72 
 
 
824 aa  152  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  28.69 
 
 
824 aa  152  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  28.81 
 
 
780 aa  151  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  26.88 
 
 
1170 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  27.7 
 
 
804 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.68 
 
 
1169 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.6 
 
 
1126 aa  149  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.5 
 
 
1188 aa  148  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  26.97 
 
 
776 aa  148  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  27.8 
 
 
793 aa  147  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  28.97 
 
 
825 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.78 
 
 
1169 aa  146  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  27.55 
 
 
811 aa  145  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  30.48 
 
 
829 aa  144  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  27.12 
 
 
817 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  27.31 
 
 
827 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  25.84 
 
 
802 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  25.8 
 
 
931 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2747  type I restriction-modification system, R subunit  26.38 
 
 
934 aa  137  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.504328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  25.51 
 
 
889 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3274  type I site-specific deoxyribonuclease  27.47 
 
 
917 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.3318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>