More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1143 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  54.72 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  54.72 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  55.66 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  54.72 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  53.77 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  53.77 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  54.72 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  52.83 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  52.83 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  52.83 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  52.83 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  52.83 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  52.48 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  52.83 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  45.28 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  51.89 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  51.89 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  51.89 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  50.94 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  52 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  52.94 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  52.94 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  49.55 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  54.08 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  53.76 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  53.61 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  54.74 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  54.74 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  54.74 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  50.96 
 
 		 110 aa  115  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  54.74 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  54.74 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  54.74 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  54.74 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  54.74 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  49.02 
 
 		 220 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  49.02 
 
 		 206 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  50 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  54.17 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  50 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  50 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  54.17 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  54.17 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  53.12 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  44.68 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  39.64 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  42.16 
 
 		 123 aa  110  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  48.98 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 119 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.72 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  47.42 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  48.08 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  44.63 
 
 		 128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  48.08 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  48.08 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  48.08 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  48.08 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  44.57 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  48.08 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  48.08 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  46.81 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  44.68 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  45.26 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>