116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1091 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1091  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
176 aa  350  4e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.801328  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0375  beta-lactamase domain-containing protein  92.05 
 
 
176 aa  320  6e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.397371  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1537  beta-lactamase domain-containing protein  90.34 
 
 
176 aa  319  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299515  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1673  beta-lactamase domain-containing protein  69.89 
 
 
174 aa  237  8e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.779907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0442  beta-lactamase domain-containing protein  56.73 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000184233  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1483  beta-lactamase domain-containing protein  45.25 
 
 
182 aa  145  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.550201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1633  beta-lactamase domain-containing protein  43.58 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.101442  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0995  beta-lactamase domain-containing protein  47.44 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0281  beta-lactamase domain-containing protein  44.13 
 
 
180 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0941  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
185 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  25.64 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  29.48 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  26.78 
 
 
204 aa  57.8  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 
233 aa  57.8  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  26.79 
 
 
250 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
205 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 
207 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 
250 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 
250 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 
250 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  27.06 
 
 
261 aa  55.5  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 
250 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 
250 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 
250 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1727  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
219 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
246 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 
266 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  24.52 
 
 
250 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 
250 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
209 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  23.56 
 
 
235 aa  47.8  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  40.79 
 
 
244 aa  47.8  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
376 aa  47.8  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
202 aa  47.8  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  30.86 
 
 
215 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  21.95 
 
 
308 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  24.62 
 
 
308 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 
253 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  39.68 
 
 
228 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  39.68 
 
 
228 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 
318 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  39.68 
 
 
228 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0078  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 
209 aa  45.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  29.32 
 
 
228 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  41.27 
 
 
228 aa  45.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  23.85 
 
 
331 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  21.56 
 
 
243 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 
198 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
226 aa  45.1  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  41.27 
 
 
228 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  22.1 
 
 
229 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  21.88 
 
 
329 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  28.18 
 
 
354 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  23.42 
 
 
248 aa  44.3  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
213 aa  44.7  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 
255 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  19.67 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2260  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 
356 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 
284 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  41.27 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
228 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  40.98 
 
 
308 aa  43.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.18 
 
 
254 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  20.41 
 
 
209 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  22.91 
 
 
257 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  22.78 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0912  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.330922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0383  beta-lactamase domain protein  32.93 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.76 
 
 
361 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0926  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.82 
 
 
268 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.62 
 
 
256 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  30 
 
 
228 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
213 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31656  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.83 
 
 
255 aa  42.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.976065  normal  0.697857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  23.03 
 
 
257 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
204 aa  42.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
203 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 
244 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  24.49 
 
 
272 aa  42  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  24.24 
 
 
346 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  36.11 
 
 
228 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  24.31 
 
 
278 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
278 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
278 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  22.86 
 
 
201 aa  42  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
272 aa  41.6  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>