More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1087 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  78.26 
 
 
412 aa  634    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  832    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  92.51 
 
 
414 aa  780    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  91.33 
 
 
415 aa  757    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  43.54 
 
 
435 aa  319  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  41.59 
 
 
414 aa  301  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  40.52 
 
 
463 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  41.76 
 
 
414 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  30.09 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  29.5 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  30.95 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  30.59 
 
 
405 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  31.19 
 
 
397 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  32.3 
 
 
397 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 
415 aa  158  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.09 
 
 
443 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  31.59 
 
 
397 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  29.52 
 
 
656 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  31.19 
 
 
397 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  29.29 
 
 
397 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  29.55 
 
 
667 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  29.55 
 
 
682 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  29.55 
 
 
682 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.83 
 
 
656 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  29.55 
 
 
667 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  30.14 
 
 
647 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 
400 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  27.19 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.34 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  30.09 
 
 
696 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  28.27 
 
 
409 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  31.06 
 
 
397 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  31.16 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  30.53 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.55 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
408 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  29.22 
 
 
648 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  29.22 
 
 
648 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  30.21 
 
 
397 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
405 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
405 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  29.55 
 
 
398 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 
405 aa  139  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.36 
 
 
648 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  29.31 
 
 
641 aa  138  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 
406 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.04 
 
 
391 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.88 
 
 
665 aa  137  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  29.9 
 
 
653 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  29.44 
 
 
409 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
409 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.65 
 
 
417 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  29.41 
 
 
410 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  30.22 
 
 
668 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  29.18 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  30.53 
 
 
651 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  27.53 
 
 
644 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.71 
 
 
642 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.67 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  29.47 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.64 
 
 
649 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 
403 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  28.11 
 
 
417 aa  133  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 
397 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 
410 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  27.12 
 
 
411 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  28.37 
 
 
409 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.64 
 
 
649 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  27.92 
 
 
410 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  27.06 
 
 
652 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  27.68 
 
 
409 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  28.06 
 
 
653 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  28.07 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  29.66 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  27.38 
 
 
394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  30.57 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.66 
 
 
653 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.88 
 
 
399 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  27.16 
 
 
649 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  27.93 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  27.9 
 
 
687 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  26.39 
 
 
394 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  29.08 
 
 
656 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  27.44 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1791  ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  28.54 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  27.87 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  29.23 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  26.75 
 
 
397 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  27.62 
 
 
681 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  29.49 
 
 
405 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  27.62 
 
 
681 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  28.44 
 
 
652 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  26.67 
 
 
646 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  29.27 
 
 
402 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  25.36 
 
 
647 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>