35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1030 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1598  30S ribosomal protein S17e  100 
 
 		 63 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1030  30S ribosomal protein S17e  100 
 
 		 63 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.413697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0316  30S ribosomal protein S17e  98.41 
 
 		 63 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1450  30S ribosomal protein S17e  92.06 
 
 		 63 aa  116  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0909  30S ribosomal protein S17e  69.84 
 
 		 63 aa  94.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.938862  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0050  30S ribosomal protein S17e  55 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0479934 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0053  30S ribosomal protein S17e  52.38 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0019  30S ribosomal protein S17e  53.97 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1459  30S ribosomal protein S17e  60.34 
 
 		 62 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1095  30S ribosomal protein S17e  52.46 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0460  ribosomal protein S17E-like protein  45.9 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.160081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1149  30S ribosomal protein S17e  55.74 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0349  ribosomal protein S17e  46.67 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0146  30S ribosomal protein S17e  50.85 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0477  30S ribosomal protein S17e  50 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.510307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1889  Ribosomal protein S17E-like protein  48.15 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0034  Ribosomal protein S17e  46.3 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05979  40S ribosomal protein S17, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10300)  43.55 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76215  40S ribosomal protein S17.e.B  46.77 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.480741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1491  30S ribosomal protein S17e  53.45 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0766  30S ribosomal protein S17e  48.15 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00222665  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1246  Ribosomal protein S17e  49.21 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02960  conserved hypothetical protein  41.94 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2260  30S ribosomal protein S17e  43.33 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.252248 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1226  SSU ribosomal protein S17E  48.28 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3917  Ribosomal protein S17E-like protein  53.19 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2585  30S ribosomal protein S17e  44.44 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.140579  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31424  Ribosomal protein S17, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.7 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00015015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2338  30S ribosomal protein S17e  44.23 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0792439  normal  0.108991 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0324  30S ribosomal protein S17e  47.62 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19314  predicted protein  32.79 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0827  ribosomal protein S17E-like  38.18 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.942401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1430  hypothetical protein  44.23 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1395  30S ribosomal protein S17e  34.48 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.407431  normal  0.322807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1262  Ribosomal protein S17e  36.07 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>