27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1024 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
106 aa  206  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  98.04 
 
 
102 aa  197  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  92.16 
 
 
102 aa  187  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  47.37 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  42.11 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1427  branched-chain amino acid transport  42.17 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0169671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0662  branched-chain amino acid transport  40.74 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00834286  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2544  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000678666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  36.67 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0649  branched-chain amino acid transport  38.14 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000140027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  35.82 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  31.58 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0120  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000282674  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  22.92 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  22.12 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0943  branched-chain amino acid transport  32.32 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000713443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  26.37 
 
 
103 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 
95 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  26.37 
 
 
103 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  26.37 
 
 
103 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  29.9 
 
 
108 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  26.37 
 
 
103 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  26.37 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  26.37 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  28.72 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>