200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0972 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  96.39 
 
 
194 aa  388  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  93.3 
 
 
194 aa  380  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  75.77 
 
 
194 aa  308  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  56.41 
 
 
195 aa  228  6e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  53.89 
 
 
197 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  52.33 
 
 
191 aa  200  1e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  1.1253e-05 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  50.78 
 
 
190 aa  191  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  47.92 
 
 
191 aa  191  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  50.78 
 
 
190 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  48.44 
 
 
191 aa  184  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  51.87 
 
 
196 aa  183  2e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  51.34 
 
 
192 aa  182  2e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  48.7 
 
 
192 aa  181  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  48.94 
 
 
192 aa  181  7e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  50 
 
 
191 aa  180  9e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.77128e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  48.7 
 
 
190 aa  178  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  44.79 
 
 
191 aa  177  6e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  49.22 
 
 
191 aa  177  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  45.88 
 
 
190 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  45.88 
 
 
190 aa  175  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  49.2 
 
 
191 aa  175  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  49.73 
 
 
191 aa  174  7e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  46.88 
 
 
179 aa  172  2e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  45.83 
 
 
179 aa  172  2e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  46.88 
 
 
179 aa  172  3e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  47.15 
 
 
188 aa  171  4e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  47.92 
 
 
179 aa  171  7e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  45.08 
 
 
190 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  47.4 
 
 
177 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  44.39 
 
 
191 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  46.91 
 
 
195 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  45.83 
 
 
178 aa  164  6e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  42.71 
 
 
178 aa  164  6e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  44.27 
 
 
194 aa  164  6e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.4183e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  47.42 
 
 
192 aa  164  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  46.39 
 
 
195 aa  164  1e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  41.94 
 
 
191 aa  162  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.72055e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  45.83 
 
 
179 aa  162  2e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  45.83 
 
 
178 aa  163  2e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  44.79 
 
 
178 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  44.5 
 
 
191 aa  162  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  43.75 
 
 
191 aa  161  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.75235e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  42.19 
 
 
221 aa  159  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.56435e-05  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  42.47 
 
 
178 aa  158  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  46.24 
 
 
179 aa  157  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  43.09 
 
 
191 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  6.54398e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  43.09 
 
 
191 aa  157  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  42.19 
 
 
177 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.07911e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  43.23 
 
 
392 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  43.23 
 
 
181 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.48271e-09  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  42.19 
 
 
696 aa  152  3e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  39.06 
 
 
233 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  41.15 
 
 
696 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  42.7 
 
 
215 aa  149  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  42.78 
 
 
196 aa  148  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  44.09 
 
 
180 aa  148  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  41.15 
 
 
179 aa  147  1e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  39.57 
 
 
194 aa  146  2e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  42.25 
 
 
216 aa  144  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.15937e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  38.54 
 
 
179 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  39.57 
 
 
214 aa  136  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  2.89321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  41.18 
 
 
215 aa  136  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  39.04 
 
 
183 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  39.04 
 
 
183 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  39.04 
 
 
183 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  35.14 
 
 
178 aa  115  4e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  35.14 
 
 
178 aa  115  4e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  34.59 
 
 
172 aa  107  8e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  37.36 
 
 
165 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  35.33 
 
 
165 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  42.36 
 
 
139 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  41.67 
 
 
139 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  41.96 
 
 
140 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  41.67 
 
 
139 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  41.67 
 
 
139 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  36.22 
 
 
165 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  43.36 
 
 
146 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  37.93 
 
 
139 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  35.42 
 
 
164 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  44.76 
 
 
146 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  35.08 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  36.81 
 
 
166 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  36.7 
 
 
167 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  38.19 
 
 
140 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7438e-05 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  36.67 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  34.78 
 
 
166 aa  99  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  38.19 
 
 
139 aa  98.6  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  3.45358e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  34.24 
 
 
164 aa  97.8  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.58071e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  34.81 
 
 
166 aa  97.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  39.16 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  39.16 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  39.16 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  39.16 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  37.76 
 
 
139 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  38.19 
 
 
139 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  39.16 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  39.16 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  39.16 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  39.16 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>