More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0916 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  93.3 
 
 
403 aa  781    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  76.56 
 
 
403 aa  665    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  100 
 
 
403 aa  823    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  93.8 
 
 
403 aa  783    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0576  peptidase U32  69.98 
 
 
421 aa  590  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2234  hypothetical protein  39.21 
 
 
401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00649369  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1205  peptidase U32  41.69 
 
 
406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1542  collagenase  37.68 
 
 
414 aa  286  5.999999999999999e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1288  peptidase U32  37.17 
 
 
423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0903  peptidase U32  38.35 
 
 
413 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225282  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2116  peptidase U32  38.57 
 
 
416 aa  273  5.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00231465  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  36.97 
 
 
396 aa  271  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  36.39 
 
 
420 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  36.14 
 
 
413 aa  270  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  35.52 
 
 
415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  35.44 
 
 
422 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  36.72 
 
 
411 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  36.1 
 
 
414 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  35.68 
 
 
413 aa  263  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  39.13 
 
 
406 aa  250  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  38.48 
 
 
408 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.66 
 
 
411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  34.94 
 
 
420 aa  245  8e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  39.18 
 
 
407 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  37.71 
 
 
409 aa  235  8e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  37.71 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  35.8 
 
 
838 aa  234  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  38.84 
 
 
419 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  36.76 
 
 
411 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  39.14 
 
 
405 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  36.66 
 
 
426 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  40.62 
 
 
420 aa  230  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  42.11 
 
 
404 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  41.64 
 
 
439 aa  224  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  41.72 
 
 
783 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  34.23 
 
 
406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  35.29 
 
 
835 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  39.87 
 
 
430 aa  217  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  35.28 
 
 
439 aa  215  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  34.66 
 
 
848 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  34.68 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  32.59 
 
 
836 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  41.53 
 
 
767 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  33.84 
 
 
404 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  39.35 
 
 
435 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  35.28 
 
 
412 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  33.58 
 
 
886 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  37.84 
 
 
412 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  34.57 
 
 
430 aa  207  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  34.78 
 
 
428 aa  207  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  32.27 
 
 
862 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  32.35 
 
 
847 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  39.14 
 
 
411 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  33.9 
 
 
810 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  37.53 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  37.5 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  32.43 
 
 
422 aa  200  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  32.92 
 
 
423 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  39.48 
 
 
548 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  31.62 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  34.25 
 
 
410 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  36.13 
 
 
422 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  36.36 
 
 
406 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  34.46 
 
 
426 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  31.68 
 
 
422 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  31.68 
 
 
422 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  34.2 
 
 
426 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  32.53 
 
 
434 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  32.87 
 
 
438 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  39.17 
 
 
411 aa  194  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  33.68 
 
 
426 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  33.68 
 
 
426 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  33.68 
 
 
426 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  33.68 
 
 
426 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  33.68 
 
 
426 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  33.68 
 
 
426 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  33.68 
 
 
426 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  33.68 
 
 
426 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  35.03 
 
 
823 aa  193  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  32.1 
 
 
790 aa  193  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  31.44 
 
 
452 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  34.97 
 
 
826 aa  192  9e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  32.04 
 
 
426 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  37.5 
 
 
783 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  37.29 
 
 
471 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  33.16 
 
 
841 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  34.62 
 
 
428 aa  186  8e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  33.15 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  29.66 
 
 
458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  29.66 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  38.66 
 
 
746 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  35.95 
 
 
835 aa  184  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  30.05 
 
 
847 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  30.49 
 
 
462 aa  183  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  30.49 
 
 
467 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  34.07 
 
 
723 aa  182  9.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  34.29 
 
 
417 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  31.03 
 
 
839 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  35.81 
 
 
427 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  34.52 
 
 
817 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>