More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0887 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  97.46 
 
 
433 aa  822    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  85.12 
 
 
433 aa  739    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
433 aa  837    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  98.15 
 
 
433 aa  826    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.28 
 
 
460 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.61 
 
 
430 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.27 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.36 
 
 
431 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.81 
 
 
430 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.83 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.11 
 
 
431 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.11 
 
 
431 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  52.94 
 
 
431 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  52.82 
 
 
431 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.41 
 
 
431 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.98 
 
 
441 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.01 
 
 
432 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  52.58 
 
 
431 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  53.4 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.11 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.88 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  52.46 
 
 
429 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.25 
 
 
441 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  51.99 
 
 
429 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.7 
 
 
446 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.16 
 
 
453 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.23 
 
 
434 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.23 
 
 
434 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.11 
 
 
441 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.17 
 
 
429 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.08 
 
 
433 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  52.56 
 
 
430 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.88 
 
 
431 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.93 
 
 
429 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.17 
 
 
429 aa  423  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.35 
 
 
433 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  48.37 
 
 
434 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  50.93 
 
 
429 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.93 
 
 
429 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.05 
 
 
430 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  50.82 
 
 
433 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.35 
 
 
431 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.04 
 
 
442 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.93 
 
 
429 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.42 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.1 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.1 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.47 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.7 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.35 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.84 
 
 
454 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  50.35 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  49.89 
 
 
441 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  48.48 
 
 
449 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  50.35 
 
 
430 aa  415  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  49.66 
 
 
441 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  49.66 
 
 
441 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  49.89 
 
 
441 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  49.66 
 
 
441 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.53 
 
 
429 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  49.66 
 
 
441 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.53 
 
 
429 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.53 
 
 
429 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.3 
 
 
429 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.43 
 
 
465 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.53 
 
 
429 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  49.66 
 
 
441 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  49.66 
 
 
441 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  49.88 
 
 
430 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  50.35 
 
 
433 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.12 
 
 
433 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.72 
 
 
449 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.12 
 
 
433 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  48.25 
 
 
449 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  50.34 
 
 
441 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.12 
 
 
433 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.12 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.72 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  49.3 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  49.65 
 
 
433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.49 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.89 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.11 
 
 
467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.24 
 
 
430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.88 
 
 
433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.03 
 
 
449 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  49.18 
 
 
433 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  49.18 
 
 
433 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.97 
 
 
441 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  49.18 
 
 
433 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  50.35 
 
 
494 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.65 
 
 
433 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  47.74 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.49 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.61 
 
 
446 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.51 
 
 
435 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.84 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.54 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>