150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0876 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  87.71 
 
 		 179 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  83.24 
 
 		 179 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  26.09 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  23.31 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  27.49 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  24.85 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  44.29 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  26.43 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  23.81 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 253 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  29.36 
 
 		 316 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 242 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  21.43 
 
 		 232 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 372 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  25.64 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  17.86 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  29.46 
 
 		 238 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  24.85 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  28.85 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  22.35 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 124 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  23.6 
 
 		 226 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 107 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  31.18 
 
 		 252 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 112 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  37.04 
 
 		 112 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  26.19 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  23.89 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  29.6 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 213 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 277 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  24.83 
 
 		 218 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  32.43 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  30.77 
 
 		 110 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 240 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  37.68 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 110 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 114 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  26.05 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 114 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  23.08 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  20 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  20 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  20 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  20 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  28.21 
 
 		 109 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  28.28 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  20 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>