More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0864 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 248 aa  495  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  73.79 
 
 		 248 aa  344  7e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  72.47 
 
 		 248 aa  338  4e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  49.79 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  35.77 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  35.77 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 		 252 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 247 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4198  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  35.34 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.33 
 
 		 264 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.45 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  27.35 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  27.27 
 
 		 266 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.56 
 
 		 264 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.9 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.1 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.73 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  30.47 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  27.11 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0036  hypothetical protein  29.82 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.13 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.89 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.45 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0255  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4899  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.092586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2995  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5371  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0777  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277559  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.89 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2611  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.68 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0037  hypothetical protein  28.51 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  27.03 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.71 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>