More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0793 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 		 573 aa  1148    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  94.42 
 
 		 573 aa  1067    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  79.58 
 
 		 573 aa  941    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  62.48 
 
 		 562 aa  730    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  94.07 
 
 		 573 aa  1060    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  38.05 
 
 		 567 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.02 
 
 		 552 aa  378  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  37.11 
 
 		 568 aa  360  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  36.97 
 
 		 547 aa  360  3e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.86 
 
 		 550 aa  352  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.89 
 
 		 553 aa  351  2e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.35 
 
 		 548 aa  351  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  35.38 
 
 		 546 aa  348  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.45 
 
 		 556 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.91 
 
 		 592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.01 
 
 		 610 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.42 
 
 		 594 aa  288  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  31.1 
 
 		 584 aa  273  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  31.1 
 
 		 584 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  30.97 
 
 		 583 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  30.94 
 
 		 584 aa  270  8e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.44 
 
 		 588 aa  267  5e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33 
 
 		 590 aa  263  8.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  32.84 
 
 		 601 aa  258  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.72 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  30.46 
 
 		 603 aa  246  6e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  31.03 
 
 		 549 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  29.14 
 
 		 576 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.35 
 
 		 582 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.37 
 
 		 583 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  28.97 
 
 		 598 aa  230  7e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.36 
 
 		 601 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.54 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  29.05 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  27.1 
 
 		 507 aa  217  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  27.02 
 
 		 513 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  28.59 
 
 		 803 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.65 
 
 		 510 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  27.69 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  26.36 
 
 		 508 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  25.82 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  25.82 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  25.82 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  29.07 
 
 		 527 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  30.57 
 
 		 507 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.96 
 
 		 1017 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  33.24 
 
 		 512 aa  196  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  29.7 
 
 		 513 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.21 
 
 		 522 aa  195  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  27.24 
 
 		 519 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  25.34 
 
 		 534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.48 
 
 		 539 aa  190  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  29.5 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  27.91 
 
 		 719 aa  183  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  32.09 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.41 
 
 		 506 aa  178  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  25.04 
 
 		 537 aa  177  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  25.41 
 
 		 932 aa  173  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.33 
 
 		 592 aa  173  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  26.8 
 
 		 664 aa  161  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  24.46 
 
 		 651 aa  160  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  25.54 
 
 		 816 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  30.47 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  26.88 
 
 		 517 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  30.75 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  29.83 
 
 		 546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  27.72 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  32.21 
 
 		 545 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  26.82 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  26.64 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  29.83 
 
 		 546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  31.86 
 
 		 546 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  30.37 
 
 		 584 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  29.36 
 
 		 558 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  23.94 
 
 		 538 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  25.08 
 
 		 561 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  25.33 
 
 		 576 aa  126  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  28.21 
 
 		 544 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  29.97 
 
 		 558 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  26.04 
 
 		 539 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  29.87 
 
 		 530 aa  124  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  22.74 
 
 		 531 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  25.66 
 
 		 532 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  22.77 
 
 		 559 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  28.92 
 
 		 552 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  24.53 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  29.95 
 
 		 622 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1470  ATP dependent DNA ligase  25.13 
 
 		 542 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  26.79 
 
 		 514 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  25.06 
 
 		 532 aa  120  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2804  ATP-dependent DNA ligase  29.39 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414276  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  27.13 
 
 		 566 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  28.41 
 
 		 552 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  22.18 
 
 		 559 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  29.63 
 
 		 534 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  26.42 
 
 		 551 aa  116  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3873  ATP-dependent DNA ligase  27.01 
 
 		 567 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.537943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  23.66 
 
 		 532 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  27.74 
 
 		 551 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  29.12 
 
 		 630 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>