63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0770 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  100 
 
 
292 aa  593  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  57.54 
 
 
302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  48.18 
 
 
301 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  48.72 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  42.11 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  45.59 
 
 
293 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  40.54 
 
 
314 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.44 
 
 
319 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  39.78 
 
 
305 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.59 
 
 
318 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  41.14 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.84 
 
 
318 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  36.39 
 
 
321 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.4 
 
 
303 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  37.88 
 
 
299 aa  156  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.42 
 
 
340 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  31.03 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  33.33 
 
 
306 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  30.51 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.8 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  34.72 
 
 
356 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  32.46 
 
 
302 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  29.04 
 
 
301 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.43 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.42 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  26.56 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.27 
 
 
288 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.19 
 
 
312 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  33.63 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  30.19 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29.22 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  27.69 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.96 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.43 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.13 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  27.39 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.64 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.47 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29.26 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.63 
 
 
317 aa  79  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.78 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  31.78 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  28.44 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.57 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.85 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.35 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.03 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  27.7 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.32 
 
 
359 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  26.55 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.25 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.92 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  29.41 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.93 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  26.18 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  36.92 
 
 
366 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  26.06 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  45.83 
 
 
346 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.19 
 
 
324 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  29.6 
 
 
307 aa  45.8  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3868  CRISPR-associated protein TM1801  24.22 
 
 
307 aa  45.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2185  CRISPR-associated protein TM1801  26.24 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>