247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0716 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  313  5e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  93.75 
 
 
160 aa  298  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  92.5 
 
 
160 aa  296  8e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  65.61 
 
 
159 aa  216  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  35.86 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  36.55 
 
 
157 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  35.86 
 
 
157 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  32.03 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  31.72 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  35.71 
 
 
416 aa  86.3  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  37.88 
 
 
187 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  32.85 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  36.88 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  30.46 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  34.31 
 
 
195 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  34.62 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  35.34 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  34.62 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  34.03 
 
 
192 aa  67.4  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  35.16 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  33.59 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  35.66 
 
 
192 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  30.26 
 
 
214 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 
195 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  35.16 
 
 
194 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1619  SNARE associated Golgi protein  26.95 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0146715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
193 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.68 
 
 
206 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  34.07 
 
 
193 aa  61.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  27.33 
 
 
249 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  33.83 
 
 
192 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  29.2 
 
 
192 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  29.93 
 
 
188 aa  57.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  25.36 
 
 
203 aa  57.4  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  25.36 
 
 
203 aa  57.4  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  31.01 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 
195 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_002936  DET0048  hypothetical protein  28.38 
 
 
203 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254936  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  26.43 
 
 
204 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  28.38 
 
 
212 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  30.3 
 
 
227 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  28.75 
 
 
237 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  28.12 
 
 
237 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  32.5 
 
 
202 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  29.46 
 
 
193 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0045  hypothetical protein  29.05 
 
 
203 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0015548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  27.91 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.9 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.1 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  27.13 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  31.3 
 
 
210 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  29.61 
 
 
221 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  31.29 
 
 
198 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  30.88 
 
 
204 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  29.1 
 
 
202 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 
221 aa  51.2  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  31.41 
 
 
208 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  29.01 
 
 
193 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  29.01 
 
 
193 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  28.75 
 
 
201 aa  50.8  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.06 
 
 
251 aa  50.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  27.22 
 
 
211 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  29.01 
 
 
193 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  26.58 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1779  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.380295  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  30.99 
 
 
217 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  30 
 
 
212 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  27.78 
 
 
193 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.45 
 
 
194 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  33.07 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  24.54 
 
 
199 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  30.22 
 
 
221 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  30.12 
 
 
220 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  28.17 
 
 
215 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  30.77 
 
 
720 aa  48.5  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  26.85 
 
 
232 aa  47.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  30.26 
 
 
209 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  26.8 
 
 
202 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 
222 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  28.47 
 
 
195 aa  47.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  26.73 
 
 
231 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  29.27 
 
 
220 aa  47.4  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  29.27 
 
 
220 aa  47.4  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  29.27 
 
 
220 aa  47.4  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  29.61 
 
 
215 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.58 
 
 
202 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1381  membrane protein-like protein  25.19 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  28.74 
 
 
248 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  23.74 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  28.03 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  28.03 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.53 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  30.41 
 
 
215 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  30.56 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  28.38 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  32.95 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  29.85 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>