37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0709 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  248  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  248  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  99.23 
 
 
130 aa  246  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  87.69 
 
 
131 aa  223  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  72 
 
 
138 aa  184  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  51.15 
 
 
137 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  51.56 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  46.62 
 
 
137 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  47.37 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  49.61 
 
 
146 aa  114  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  46.88 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  43.08 
 
 
130 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  41.22 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  44.88 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  44.35 
 
 
120 aa  92  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  34.43 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  42.86 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  34.88 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  34.88 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  34.88 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  38.24 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  36.63 
 
 
576 aa  62  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  32.09 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  35.82 
 
 
599 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2206  hypothetical protein  32.62 
 
 
147 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  32.65 
 
 
580 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  32.97 
 
 
563 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  31.52 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  29.79 
 
 
580 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  30.49 
 
 
652 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  29.79 
 
 
580 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  29.35 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  30.85 
 
 
563 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  30.23 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  32.65 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>