285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0617 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  60.63 
 
 
222 aa  280  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  58.37 
 
 
222 aa  266  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  58.82 
 
 
222 aa  263  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  50.68 
 
 
219 aa  211  7e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  47.3 
 
 
221 aa  198  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  33.48 
 
 
242 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  38.14 
 
 
242 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  36.73 
 
 
254 aa  154  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  38.46 
 
 
226 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  32.88 
 
 
238 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  34.93 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  37.37 
 
 
244 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  32.89 
 
 
243 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  35.05 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  35.32 
 
 
232 aa  128  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  33.8 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  32.43 
 
 
245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  35.47 
 
 
244 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  33.64 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  29.58 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  33.03 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  31.36 
 
 
237 aa  118  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  32.27 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  33.63 
 
 
245 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  29.55 
 
 
242 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  33.95 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  31.82 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  29.81 
 
 
247 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  32.02 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  30.73 
 
 
238 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  30.99 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  26.36 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  29.33 
 
 
231 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  27.73 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  35.87 
 
 
237 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  29.25 
 
 
235 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
232 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  31.65 
 
 
224 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.48 
 
 
243 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  32.2 
 
 
243 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  30.14 
 
 
238 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  27.8 
 
 
261 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  33.8 
 
 
206 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  30.14 
 
 
224 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  29.44 
 
 
259 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  32.55 
 
 
230 aa  101  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  30 
 
 
242 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  29.38 
 
 
236 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  32.65 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  31.4 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  30.1 
 
 
223 aa  98.6  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  29.68 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  29.68 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  29.05 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  29 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  30.92 
 
 
245 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  27.65 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  28.16 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  32.83 
 
 
227 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  28.57 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  31.46 
 
 
481 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  28.43 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  30.14 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  30.14 
 
 
235 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  30.14 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  29.67 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  31.22 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  28.37 
 
 
235 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  27.12 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  28.91 
 
 
235 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  28.37 
 
 
235 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  28.37 
 
 
235 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  29.19 
 
 
235 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  30.19 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  28.71 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  30.29 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  30.37 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  26.07 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  24.46 
 
 
253 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  26.19 
 
 
217 aa  89  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  28.99 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  28.43 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  31.34 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  26.98 
 
 
184 aa  87.4  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  28.43 
 
 
240 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  37.31 
 
 
141 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  27.89 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  26.6 
 
 
240 aa  84.7  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.95 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  26.36 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.77 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  26.79 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  31.72 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  26.6 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  26.17 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  26.92 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>