More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0513 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  95.13 
 
 		 411 aa  779    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  81.93 
 
 		 414 aa  679    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 411 aa  810    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  93.43 
 
 		 411 aa  761    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  66.75 
 
 		 411 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  44.44 
 
 		 399 aa  331  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  43.46 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  44.64 
 
 		 403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  41.98 
 
 		 400 aa  306  6e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.74 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.27 
 
 		 397 aa  296  6e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  40.49 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  39.53 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  44.1 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  39.2 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  39.75 
 
 		 401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  37.53 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  39.45 
 
 		 404 aa  285  7e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  39.45 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  37.24 
 
 		 402 aa  279  7e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  36.32 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  37.37 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  37.19 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  33.25 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  35.02 
 
 		 405 aa  209  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.92 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  29.04 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  31.68 
 
 		 374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.52 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.72 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.87 
 
 		 393 aa  192  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  36.28 
 
 		 393 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  29.98 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.07 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  32.44 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.82 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.15 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  29.54 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.01 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.11 
 
 		 354 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.38 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.53 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.12 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.98 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.17 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39 
 
 		 376 aa  175  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  33.23 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  30.17 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.93 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  33.73 
 
 		 355 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.35 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.91 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.23 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.7 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  32.8 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  33.04 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.31 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.84 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.76 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.92 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.74 
 
 		 355 aa  167  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.52 
 
 		 355 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.25 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.12 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  29.14 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.5 
 
 		 355 aa  162  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.84 
 
 		 355 aa  163  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  31.93 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  28.79 
 
 		 830 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.64 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  31.23 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  27.58 
 
 		 820 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.19 
 
 		 349 aa  155  9e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  28.13 
 
 		 832 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.7 
 
 		 358 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  29.9 
 
 		 827 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  30.18 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.43 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0271  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.59 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.43 
 
 		 357 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  26.94 
 
 		 820 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.25 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2516  Nucleotidyl transferase  28.27 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  29.8 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.55 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0103  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.78 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000174332  normal  0.950143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  27.58 
 
 		 832 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.46 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.52 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3873  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.45 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2323  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.19 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.845918  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  25.67 
 
 		 854 aa  150  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  28.82 
 
 		 833 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  27.65 
 
 		 366 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>