More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0408 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  97.7 
 
 		 348 aa  669    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  98.56 
 
 		 348 aa  686    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  100 
 
 		 348 aa  694    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  74.43 
 
 		 349 aa  536  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  52.77 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  53.71 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  53.62 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  54.14 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  53.85 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  50.29 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  55.1 
 
 		 370 aa  348  7e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  48.41 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  49.28 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  49.86 
 
 		 358 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  52.4 
 
 		 359 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  51.59 
 
 		 336 aa  325  5e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  45.95 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  46.53 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  50.15 
 
 		 357 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  45.93 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  45.38 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  48.97 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  48.84 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  46.78 
 
 		 356 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  43.45 
 
 		 355 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  43.14 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.87 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  43.3 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.57 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.39 
 
 		 367 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  37.39 
 
 		 374 aa  239  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  40.41 
 
 		 369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  40.11 
 
 		 383 aa  229  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  39.01 
 
 		 375 aa  227  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  39.6 
 
 		 361 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  36.62 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  44.76 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  37.85 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  41.04 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  45.89 
 
 		 362 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  38.41 
 
 		 331 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  35.51 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  37.43 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  40.78 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.2 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  37.89 
 
 		 330 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  39.22 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  34.97 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  33.53 
 
 		 357 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  38.21 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  33.82 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  38.79 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  33.82 
 
 		 356 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  39.66 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1284  transport system permease protein  40.75 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.601831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40.14 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.98 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.2 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.07 
 
 		 354 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  38.76 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.28 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  36.53 
 
 		 323 aa  193  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  36.83 
 
 		 359 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.34 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  41.84 
 
 		 354 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  37.06 
 
 		 360 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  35.24 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  35.43 
 
 		 340 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  36.96 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1787  hemin ABC transporter, permease protein, putative  35.24 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  36.96 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  36.96 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  35.78 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.58 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  35.43 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  34.12 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  34.6 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.02 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  37.97 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  32.95 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.39 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  40.28 
 
 		 372 aa  186  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  38.75 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  38.31 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  37.97 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  37.63 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 		 352 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  37.41 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.72 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  35.98 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36.02 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  36.36 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  36.39 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>