154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0389 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  92.35 
 
 		 183 aa  352  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  90.16 
 
 		 183 aa  341  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  68.82 
 
 		 189 aa  239  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  54.14 
 
 		 192 aa  197  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  37.67 
 
 		 203 aa  100  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  35.12 
 
 		 301 aa  96.7  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  35.66 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  36.36 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  36.36 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  33.73 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  34.18 
 
 		 323 aa  85.1  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  34.18 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  33.33 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  33.7 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  31.82 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  32.48 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  33.11 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  33.11 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  31.33 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  31.33 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  30.54 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  31.61 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  30.82 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  33.33 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30.82 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  28.16 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  29.73 
 
 		 350 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  25.52 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  31.03 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  30.72 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  25 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  33.6 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  27.59 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  30.14 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  31.41 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  31.33 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  31.86 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  25.61 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  27.33 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  28.47 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  28.47 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.46 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  28.08 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  26.17 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  24.29 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  31.03 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  26.17 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  33.59 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf871  nuclease, lipoprotein  29.45 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  27.4 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  28.65 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  25.68 
 
 		 372 aa  58.2  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  31.21 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  25.68 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  29.19 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  27.81 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  30.34 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  25.64 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  26.28 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  27.33 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  28.39 
 
 		 351 aa  55.5  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  35.37 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  29.37 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  27.89 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  27.66 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  27.74 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  25.58 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  28.08 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  29.05 
 
 		 260 aa  54.3  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  27.16 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  28.38 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  28.19 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  25.35 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  25.84 
 
 		 256 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  28.38 
 
 		 273 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  27.81 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  26.01 
 
 		 153 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  25.17 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  26.57 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  25.77 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  27.22 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  26.97 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  25.69 
 
 		 247 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  29.8 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  28.25 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0407  nuclease (SNase-like)  29.75 
 
 		 308 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  26.4 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  24.66 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  29.03 
 
 		 534 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  29.66 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  28.47 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  23.78 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  29.05 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  25.81 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  26.58 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  29.93 
 
 		 408 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  24.84 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  27.74 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  24.29 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>