More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0313 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
122 aa  234  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  93.44 
 
 
122 aa  220  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  88.52 
 
 
122 aa  213  9e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  72.95 
 
 
122 aa  183  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  67.65 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  47.86 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  47.86 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  47.86 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  47.86 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
124 aa  94  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 
124 aa  94  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  49.15 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  48.31 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  44.92 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
124 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
129 aa  84  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  43.97 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 
124 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.53 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  46.73 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  43.43 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  48.11 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  49.14 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  46.85 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  44.64 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  37.29 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  49.46 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  41.32 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  40.87 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  38.14 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  43.36 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  47.9 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  43.93 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  48.81 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  37.93 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  46.08 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  46.36 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  45.95 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  43.22 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  37.93 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  46.23 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1099  crcB protein  40.37 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.236283  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  46.07 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  45.45 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  44.79 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  42.42 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  40.52 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.55 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  46.99 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40.87 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.84 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  33.07 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  41.38 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  44.44 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>