28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0288 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  93.13 
 
 
468 aa  888    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  94.65 
 
 
467 aa  897    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  942    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  68.8 
 
 
468 aa  658    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  53.49 
 
 
501 aa  530  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.2 
 
 
379 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  24.55 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  22.87 
 
 
376 aa  67  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  22.69 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  23.96 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  21.58 
 
 
396 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  25.64 
 
 
401 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  21.28 
 
 
396 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  25.39 
 
 
396 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  19.11 
 
 
387 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  21.15 
 
 
383 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  25.75 
 
 
402 aa  50.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25.5 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  38.57 
 
 
382 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  22.73 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  20.28 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  18.03 
 
 
390 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  17.75 
 
 
390 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  22.19 
 
 
416 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  22.89 
 
 
402 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  21.14 
 
 
386 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  21.22 
 
 
386 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  25.93 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>