19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0094 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0094  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  703  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2253  hypothetical protein  38.69 
 
 
617 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3118  hypothetical protein  43.67 
 
 
594 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.092965  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1286  hypothetical protein  34.15 
 
 
762 aa  99  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  39.09 
 
 
537 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1903  hypothetical protein  33.04 
 
 
628 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3227  hypothetical protein  33.96 
 
 
534 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1135  hypothetical protein  32.99 
 
 
579 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00673541  hitchhiker  0.000103654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2307  hypothetical protein  37.24 
 
 
644 aa  86.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.20595e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0294  hypothetical protein  38.54 
 
 
654 aa  86.3  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3210  hypothetical protein  40.65 
 
 
592 aa  82.8  9e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.575907  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30080  hypothetical protein  32.54 
 
 
616 aa  82  1e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.798837  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0376  hypothetical protein  36.97 
 
 
742 aa  82.8  1e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2159  hypothetical protein  35.32 
 
 
286 aa  78.2  2e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03560  hypothetical protein  33.33 
 
 
676 aa  78.2  2e-13  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0660497  normal  0.0241911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1136  hypothetical protein  30.1 
 
 
598 aa  76.6  6e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0147757  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23850  hypothetical protein  30.9 
 
 
460 aa  74.3  3e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0149528  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0626  hypothetical protein  32.02 
 
 
504 aa  73.2  7e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0131  hypothetical protein  30.95 
 
 
644 aa  66.2  8e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>