More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0091 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  93.26 
 
 
267 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  92.13 
 
 
267 aa  493  1e-138  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  74.72 
 
 
269 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  55.26 
 
 
270 aa  313  3e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  54.86 
 
 
258 aa  291  8e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  47.41 
 
 
273 aa  258  8e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  49.81 
 
 
301 aa  251  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  40.4 
 
 
280 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  40.4 
 
 
286 aa  195  8e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  39.54 
 
 
494 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 
538 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 
544 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  38 
 
 
275 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  36.61 
 
 
547 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  39.2 
 
 
288 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  38.8 
 
 
288 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  36.25 
 
 
561 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  38 
 
 
287 aa  185  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  34.11 
 
 
534 aa  185  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 
550 aa  184  1e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 
551 aa  183  2e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 
551 aa  183  2e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 
547 aa  184  2e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 
540 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  37.15 
 
 
532 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 
533 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 
549 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 
549 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 
549 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  38.15 
 
 
268 aa  179  5e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  36.36 
 
 
563 aa  179  6e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  36.89 
 
 
292 aa  179  6e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 
276 aa  174  2e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 
270 aa  173  3e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 
298 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  33.2 
 
 
275 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  38.89 
 
 
200 aa  166  3e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 
274 aa  165  7e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  34.41 
 
 
274 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  33.47 
 
 
531 aa  164  1e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 
268 aa  164  1e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 
275 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  1.88457e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 
275 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  35.89 
 
 
275 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 
275 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.45897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 
275 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  5.13684e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 
275 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.76183e-05  hitchhiker  5.23866e-11 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  33.86 
 
 
276 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  35.6 
 
 
274 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  2.48019e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 
275 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.53066e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 
288 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  33.89 
 
 
274 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 
275 aa  159  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 
283 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 
275 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  34.29 
 
 
269 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  33.86 
 
 
281 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  31.6 
 
 
275 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  34.27 
 
 
274 aa  155  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 
297 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  35.89 
 
 
277 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 
275 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.24466e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 
279 aa  152  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.14 
 
 
277 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.91532e-08  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 
322 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 
273 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  35.08 
 
 
279 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 
275 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 
288 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  34.58 
 
 
279 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 
277 aa  148  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  36.4 
 
 
274 aa  148  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 
291 aa  147  2e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  31.6 
 
 
286 aa  146  4e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  31.6 
 
 
286 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  31.6 
 
 
286 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  31.6 
 
 
286 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  31.6 
 
 
286 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 
288 aa  145  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 
286 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  31.6 
 
 
286 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  31.6 
 
 
286 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  31.6 
 
 
291 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  34.2 
 
 
294 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 
277 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  31.42 
 
 
275 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
266 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 
280 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 
289 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.6 
 
 
289 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  33.19 
 
 
276 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.6 
 
 
289 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 
305 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 
287 aa  141  1e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.85336e-06 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 
305 aa  140  2e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  32.4 
 
 
284 aa  140  2e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.79081e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
291 aa  140  2e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 
360 aa  140  2e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>