More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0089 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
458 aa  927  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  82.1 
 
 
458 aa  784  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  97.82 
 
 
458 aa  912  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  94.98 
 
 
458 aa  889  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.08 
 
 
474 aa  624  1e-178  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.86 
 
 
443 aa  320  3e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.05 
 
 
437 aa  305  8e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  41.03 
 
 
445 aa  305  1e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.21 
 
 
444 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.67 
 
 
442 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  34.65 
 
 
467 aa  256  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  35.79 
 
 
445 aa  253  5e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  2.58626e-13 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.51 
 
 
446 aa  250  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.49 
 
 
483 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.09 
 
 
469 aa  247  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  4.9629e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.47 
 
 
442 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.79 
 
 
460 aa  247  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.13 
 
 
462 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.64 
 
 
476 aa  233  8e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.94 
 
 
460 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01587e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  33.63 
 
 
460 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  35.68 
 
 
464 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.64 
 
 
464 aa  229  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.34 
 
 
460 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  34.93 
 
 
466 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.84 
 
 
461 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.85 
 
 
456 aa  227  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.46 
 
 
475 aa  226  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.33 
 
 
485 aa  226  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.86 
 
 
465 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.07 
 
 
458 aa  222  9e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.91 
 
 
454 aa  222  1e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.35 
 
 
463 aa  222  1e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  32.52 
 
 
460 aa  221  2e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.81 
 
 
470 aa  220  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.15 
 
 
463 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.15 
 
 
463 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.58 
 
 
454 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.48 
 
 
464 aa  216  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  35.45 
 
 
458 aa  214  3e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.97 
 
 
467 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.02 
 
 
497 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.29 
 
 
462 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  29.98 
 
 
461 aa  206  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  29.98 
 
 
461 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.01 
 
 
462 aa  202  1e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.86 
 
 
462 aa  202  1e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.69 
 
 
475 aa  201  2e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.55 
 
 
491 aa  201  2e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.78 
 
 
462 aa  201  2e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.75 
 
 
465 aa  200  4e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.56 
 
 
450 aa  199  1e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.16 
 
 
460 aa  198  1e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.89 
 
 
462 aa  198  2e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.69 
 
 
455 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 
477 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  32.98 
 
 
475 aa  196  8e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.56 
 
 
481 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  31.42 
 
 
481 aa  192  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  31.61 
 
 
481 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  30.96 
 
 
481 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  31.51 
 
 
481 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.67 
 
 
486 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  28.89 
 
 
486 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  30.96 
 
 
481 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.18 
 
 
479 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  31.64 
 
 
479 aa  190  6e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.64 
 
 
479 aa  189  6e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.67 
 
 
486 aa  190  6e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.64 
 
 
479 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  30.51 
 
 
481 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  30.51 
 
 
481 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.24 
 
 
481 aa  189  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  30.51 
 
 
481 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  30.51 
 
 
481 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  30.51 
 
 
481 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  30.51 
 
 
481 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.51 
 
 
481 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  29.74 
 
 
481 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  30.58 
 
 
481 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  30.86 
 
 
481 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  29.18 
 
 
477 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.16782e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  29.44 
 
 
491 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  31.43 
 
 
481 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.63 
 
 
459 aa  186  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  29.18 
 
 
477 aa  186  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.15 
 
 
490 aa  185  1e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  30.58 
 
 
481 aa  184  2e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  31.49 
 
 
480 aa  185  2e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.16 
 
 
487 aa  183  5e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.16 
 
 
487 aa  183  5e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  30.54 
 
 
481 aa  183  5e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  31.49 
 
 
480 aa  183  5e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.31 
 
 
489 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  29.95 
 
 
482 aa  182  8e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  30.44 
 
 
483 aa  182  9e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.66 
 
 
486 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  29.41 
 
 
481 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.25 
 
 
495 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.35 
 
 
459 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>