More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0085 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
185 aa  362  1e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  98.38 
 
 
185 aa  355  1e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  97.3 
 
 
185 aa  352  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  87.57 
 
 
185 aa  314  4e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  71.34 
 
 
179 aa  227  8e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
187 aa  170  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
182 aa  167  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
166 aa  142  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
186 aa  134  6e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
191 aa  134  7e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  40.94 
 
 
170 aa  133  1e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
215 aa  128  4e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 
201 aa  125  4e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  4.76622e-05 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
169 aa  122  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
183 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
174 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.75 
 
 
477 aa  109  2e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 
181 aa  109  2e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
167 aa  109  2e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
172 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.37 
 
 
482 aa  107  7e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  33.93 
 
 
474 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.54 
 
 
500 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
191 aa  104  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
201 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  40.74 
 
 
202 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.33 
 
 
479 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.33 
 
 
479 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
193 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
201 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
206 aa  101  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
190 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
186 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2360  orotate phosphoribosyltransferase  39.64 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.166662 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
194 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  4.52779e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 
178 aa  98.2  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 
185 aa  98.2  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
208 aa  98.2  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 
215 aa  97.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 
193 aa  97.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  32.6 
 
 
194 aa  97.8  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  37.82 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  37.82 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  34.39 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
175 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  33.89 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 
195 aa  95.1  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
188 aa  94.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  37.71 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
186 aa  92  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  33.15 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  37.18 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38490  orotate phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.51938e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  32.79 
 
 
177 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
203 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
192 aa  87.8  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
191 aa  87.8  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 
192 aa  87  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  3.86496e-08 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 
208 aa  86.3  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  37.27 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 
179 aa  85.1  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
187 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
187 aa  84.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
189 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
190 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
189 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
182 aa  84.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
183 aa  84  1e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5105  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
193 aa  82.8  2e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.077972  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  34.62 
 
 
178 aa  83.2  2e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2110  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
189 aa  82.8  3e-15  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
193 aa  82  5e-15  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  32.96 
 
 
188 aa  82  5e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1455  orotate phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
185 aa  80.9  9e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
217 aa  80.5  1e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 
188 aa  80.5  1e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
195 aa  79.7  2e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>