16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0084 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0084  S-layer protein  100 
 
 
447 aa  877  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1181  S-layer family protein  97.76 
 
 
447 aa  838  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0737  hypothetical protein  91.28 
 
 
447 aa  787  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.854836 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0802  S-layer protein  67.56 
 
 
444 aa  618  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.648701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  38.98 
 
 
437 aa  280  3e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  40.96 
 
 
976 aa  60.1  7e-08  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  24.51 
 
 
531 aa  55.1  3e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  41.67 
 
 
712 aa  54.3  4e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0165  hypothetical protein  34.83 
 
 
312 aa  53.9  5e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00021132  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  37.33 
 
 
535 aa  52  2e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0135  hypothetical protein  38.46 
 
 
754 aa  52  2e-05  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0602047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  36.47 
 
 
718 aa  51.6  3e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  38.89 
 
 
424 aa  50.4  6e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  9.02281e-09 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  35.29 
 
 
1336 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  33.33 
 
 
561 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5246  hypothetical protein  25.77 
 
 
1117 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>