242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0082 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  95.48 
 
 
332 aa  660  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  100 
 
 
332 aa  682  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  93.37 
 
 
332 aa  652  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  85.15 
 
 
334 aa  589  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  64.78 
 
 
341 aa  444  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  40.07 
 
 
305 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.55927e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  38.33 
 
 
311 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  38.38 
 
 
305 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  39.1 
 
 
310 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  39.32 
 
 
321 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  39.04 
 
 
307 aa  226  6e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  38.93 
 
 
311 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.31814e-06 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0609  putative radical SAM protein  38.64 
 
 
331 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.165086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  33.55 
 
 
307 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  36.45 
 
 
306 aa  217  3e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  37.38 
 
 
320 aa  215  1e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1850  hypothetical protein  37.83 
 
 
317 aa  213  3e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1815  hypothetical protein  37.83 
 
 
317 aa  213  3e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.501711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  36.61 
 
 
328 aa  213  5e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  36.72 
 
 
317 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  39 
 
 
319 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  36.36 
 
 
319 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  7.17489e-15 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  38.67 
 
 
319 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  37.71 
 
 
313 aa  210  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  38.67 
 
 
319 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  39.33 
 
 
319 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  39 
 
 
319 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  39 
 
 
319 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  38.67 
 
 
319 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  38.67 
 
 
319 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  38.67 
 
 
319 aa  208  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  38.67 
 
 
319 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  36.46 
 
 
311 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  38 
 
 
319 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  36.01 
 
 
318 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  38.72 
 
 
316 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  34.11 
 
 
319 aa  201  2e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  34.77 
 
 
316 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  3.45504e-07 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  33.88 
 
 
304 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  35.08 
 
 
338 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  33.12 
 
 
319 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  33.55 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  33.22 
 
 
313 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  33.87 
 
 
318 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  34.45 
 
 
334 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  32.66 
 
 
312 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0408  putative radical SAM protein  35.47 
 
 
313 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  32.81 
 
 
319 aa  183  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  31.16 
 
 
372 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  33.11 
 
 
330 aa  182  5e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  34.69 
 
 
300 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1401  hypothetical protein  34.02 
 
 
311 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  34.32 
 
 
325 aa  178  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  34.02 
 
 
314 aa  178  9e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  34.24 
 
 
303 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  33.9 
 
 
303 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  31.15 
 
 
312 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  31.56 
 
 
316 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  33.33 
 
 
311 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  33.33 
 
 
311 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  32.89 
 
 
319 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  31.07 
 
 
317 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  35.88 
 
 
318 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3355  hypothetical protein  32.65 
 
 
317 aa  176  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.378299  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  32.43 
 
 
351 aa  174  2e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  28.57 
 
 
314 aa  174  2e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  28.66 
 
 
347 aa  173  3e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  32.23 
 
 
314 aa  174  3e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  30.16 
 
 
309 aa  173  4e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  30.82 
 
 
328 aa  173  4e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  30.16 
 
 
309 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  30.16 
 
 
309 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  30.16 
 
 
309 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  30.16 
 
 
309 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  30.16 
 
 
309 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  30.16 
 
 
309 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  30.16 
 
 
320 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  30.16 
 
 
309 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  30.9 
 
 
309 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  29.21 
 
 
329 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  29.21 
 
 
307 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  30.69 
 
 
308 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  29.84 
 
 
309 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  29.84 
 
 
309 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  29.84 
 
 
309 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  29.84 
 
 
309 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  29.51 
 
 
309 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  29.21 
 
 
327 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  30.87 
 
 
304 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  32.79 
 
 
317 aa  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  30.23 
 
 
309 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  31.15 
 
 
309 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  31.8 
 
 
313 aa  166  6e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  30.57 
 
 
309 aa  165  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  165  1e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  30.19 
 
 
309 aa  164  2e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  30.71 
 
 
317 aa  163  4e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  29.87 
 
 
309 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  27.99 
 
 
368 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  30.65 
 
 
322 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>