More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0067 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
252 aa  506  1e-142  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  86.11 
 
 
252 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  85.32 
 
 
252 aa  444  1e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  66.53 
 
 
252 aa  346  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
253 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
252 aa  147  2e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 
254 aa  146  4e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  37.44 
 
 
253 aa  146  4e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  6.6734e-09 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
254 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 
246 aa  145  7e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  6.60342e-09 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 
253 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  34.16 
 
 
251 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 
248 aa  141  1e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 
252 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 
248 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 
239 aa  128  7e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
248 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 
248 aa  121  1e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
247 aa  115  7e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
243 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.18 
 
 
264 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.07 
 
 
284 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
264 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.07 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.07 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
264 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.07 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.07 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.07 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
264 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.07 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  25.75 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.5 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  25.22 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.67 
 
 
257 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.24 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 
266 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  24.8 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  24.8 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
290 aa  85.5  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
265 aa  85.1  1e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28.46 
 
 
266 aa  84.3  2e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28.46 
 
 
266 aa  84.3  2e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.46 
 
 
266 aa  84.3  2e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.14 
 
 
266 aa  84  2e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
266 aa  83.2  4e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
260 aa  82.4  6e-15  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
255 aa  82  7e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2604  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.19 
 
 
260 aa  82  8e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1342  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.19 
 
 
260 aa  82  8e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.232393  normal  0.759434 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2460  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.19 
 
 
260 aa  82  8e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  25.51 
 
 
273 aa  82  8e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02235  lysine/arginine/ornithine transporter subunit  26.19 
 
 
260 aa  82  8e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02195  hypothetical protein  26.19 
 
 
260 aa  82  8e-15  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1346  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.19 
 
 
260 aa  82  8e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2688  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.07 
 
 
260 aa  81.6  1e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3450  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.07 
 
 
260 aa  81.6  1e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
260 aa  81.6  1e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2705  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.07 
 
 
260 aa  80.5  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588251  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.23 
 
 
264 aa  80.5  2e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  27.88 
 
 
265 aa  80.5  2e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
270 aa  80.9  2e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.56 
 
 
243 aa  80.5  2e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  27.56 
 
 
243 aa  80.5  2e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  26.46 
 
 
275 aa  80.5  2e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  27.56 
 
 
243 aa  80.5  2e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.23 
 
 
264 aa  80.5  3e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
270 aa  80.5  3e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4136  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.91 
 
 
260 aa  80.1  3e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.502518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
281 aa  80.1  3e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
264 aa  80.5  3e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25 
 
 
259 aa  79.7  4e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.78527e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25 
 
 
259 aa  79.7  4e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.39221e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25 
 
 
259 aa  79.7  4e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.38178e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.81 
 
 
259 aa  80.1  4e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25 
 
 
259 aa  79.7  4e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  9.88465e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25 
 
 
259 aa  79.7  4e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.03966e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.23 
 
 
264 aa  79.7  4e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25 
 
 
259 aa  79.7  4e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.52358e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2542  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.07 
 
 
260 aa  79.3  5e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.579681  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.77 
 
 
264 aa  79.3  5e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  29.77 
 
 
264 aa  79.3  5e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.77 
 
 
264 aa  79.3  5e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0513  extracellular solute-binding protein family 3  24.77 
 
 
269 aa  79.3  5e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  29.77 
 
 
264 aa  79.3  5e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2584  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.07 
 
 
260 aa  79.3  5e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
259 aa  79.3  5e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2496  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.07 
 
 
260 aa  79.3  5e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
266 aa  79.3  5e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>