22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0066 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0066  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  310  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.245221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0755  hypothetical protein  81.41 
 
 
157 aa  258  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0116387  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1163  hypothetical protein  76.87 
 
 
157 aa  231  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0908413  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0821  hypothetical protein  52.52 
 
 
151 aa  148  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0628  hypothetical protein  48.92 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0139  hypothetical protein  28.87 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00590942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0156  hypothetical protein  27.66 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.285147  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1701  hypothetical protein  31.47 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0779  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0084  hypothetical protein  24.48 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00120536  hitchhiker  0.000282257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1099  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0201  hypothetical protein  30.56 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.942799 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1179  hypothetical protein  35.24 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135137  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0776  hypothetical protein  35.35 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1788  hypothetical protein  23.78 
 
 
162 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307955  hitchhiker  0.000000105503 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1175  hypothetical protein  35.16 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1818  hypothetical protein  25.17 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0138  hypothetical protein  23.78 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0843  hypothetical protein  25.17 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1295  hypothetical protein  25.17 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1500  hypothetical protein  32.97 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.218637  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1621  hypothetical protein  31.58 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000153877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>