71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0053 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  676  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  94.41 
 
 
340 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  91.76 
 
 
340 aa  607  1e-172  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  71.18 
 
 
340 aa  472  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  51.83 
 
 
338 aa  343  2e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  26.41 
 
 
281 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  26.42 
 
 
347 aa  85.1  1e-15  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  23.63 
 
 
378 aa  80.9  3e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  23.41 
 
 
370 aa  79  1e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  25.55 
 
 
322 aa  78.2  2e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  22.55 
 
 
586 aa  76.3  7e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  24.71 
 
 
385 aa  75.9  9e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.97 
 
 
360 aa  74.7  2e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  26.24 
 
 
342 aa  72.8  9e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  25.43 
 
 
347 aa  72.8  9e-12  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  21.99 
 
 
347 aa  71.6  2e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.27 
 
 
350 aa  69.7  7e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  22.03 
 
 
346 aa  69.3  8e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  23.42 
 
 
346 aa  68.6  1e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  23.78 
 
 
316 aa  67.8  2e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  6.6001e-05 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  25.25 
 
 
352 aa  65.9  1e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  24.68 
 
 
321 aa  64.7  2e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  22.64 
 
 
333 aa  64.3  3e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  23.34 
 
 
351 aa  64.3  3e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  23.12 
 
 
334 aa  63.5  5e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  26.15 
 
 
339 aa  62  1e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  21.22 
 
 
386 aa  61.2  2e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  23.42 
 
 
347 aa  61.6  2e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  22.92 
 
 
328 aa  60.8  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  22.35 
 
 
348 aa  60.8  3e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  21.05 
 
 
342 aa  60.5  5e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  26.01 
 
 
354 aa  57.4  4e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.3815e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  25.91 
 
 
324 aa  55.8  1e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  24.09 
 
 
392 aa  55.1  2e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  6.83959e-15 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  23.97 
 
 
574 aa  53.9  4e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  22.55 
 
 
340 aa  52.8  1e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  21.35 
 
 
320 aa  52  1e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  22.73 
 
 
338 aa  52  1e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.43 
 
 
333 aa  52  1e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  25.1 
 
 
322 aa  51.2  2e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  19.08 
 
 
304 aa  51.6  2e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  22.73 
 
 
346 aa  51.6  2e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  30.7 
 
 
341 aa  51.6  2e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  20.35 
 
 
341 aa  49.7  8e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  22.48 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  23.55 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  25.7 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  20.06 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  22.01 
 
 
392 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  21.25 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  21.48 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  22.62 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  22.01 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  21.81 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  20.99 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  27.12 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  27.41 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  24.54 
 
 
396 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  23.23 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  22.15 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  21.64 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  19.57 
 
 
377 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  21.99 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  23.93 
 
 
366 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  1.8752e-07  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  22.11 
 
 
325 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  22.77 
 
 
344 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  18.85 
 
 
345 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  20.14 
 
 
391 aa  42.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>