173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0051 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  98.22 
 
 		 281 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  97.15 
 
 		 281 aa  508  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  81.14 
 
 		 291 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  61.92 
 
 		 280 aa  358  4e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  39.64 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  42.01 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  39.93 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  39.44 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  54.34 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  38.06 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  37.24 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  34.39 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  34.33 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  47.65 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  33.6 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  31.43 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  33.2 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  26.59 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  28.57 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  28.57 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  28.57 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  28.57 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  24.12 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  28.19 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  25.66 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  27.03 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  26.35 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  26.32 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  26.32 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  25.87 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  28.63 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  23.97 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.61 
 
 		 762 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  25.27 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  24.72 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  25.26 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.41 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  22.96 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  27.23 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  24.31 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  25.19 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  23.53 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  24.52 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  25.66 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  26.23 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  22.62 
 
 		 761 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  27.09 
 
 		 740 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  25.44 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  25.95 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  27.87 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  25.28 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  26.24 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  25.29 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  25.86 
 
 		 318 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  26.64 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  26.64 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  25.25 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  21.57 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.09 
 
 		 750 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  25.1 
 
 		 313 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  26.45 
 
 		 293 aa  52.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  24.45 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  25.65 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  23.93 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  22.07 
 
 		 759 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  27.24 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  26.44 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.72 
 
 		 755 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  26.17 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  26.75 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  26.04 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.45 
 
 		 834 aa  50.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  23.58 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  25.42 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  22.01 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  26.79 
 
 		 315 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  25.1 
 
 		 327 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  24.91 
 
 		 324 aa  49.3  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  24.28 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  24.54 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.76 
 
 		 839 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  23.86 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  28.42 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  28.28 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  26.67 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  23.36 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  26.18 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  25.7 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  23.86 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  23.86 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  23.86 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  23.86 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  23.86 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  23.74 
 
 		 414 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  23.17 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  25.56 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.19 
 
 		 844 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  30.08 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  24.79 
 
 		 319 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>