20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0034 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0034  haloacid dehalogenase superfamily protein  100 
 
 
196 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1128  haloacid dehalogenase superfamily protein  96.43 
 
 
196 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0790  haloacid dehalogenase superfamily protein  92.35 
 
 
196 aa  356  1e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0856  haloacid dehalogenase superfamily protein  64.43 
 
 
196 aa  245  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0808  haloacid dehalogenase superfamily protein  49.21 
 
 
205 aa  181  7e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  38.76 
 
 
223 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  38.12 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0076  Translin  34.46 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  30.37 
 
 
216 aa  85.5  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  32.34 
 
 
204 aa  73.6  2e-12  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  29.73 
 
 
208 aa  71.6  6e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  34.07 
 
 
204 aa  71.6  6e-12  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  25 
 
 
228 aa  69.3  3e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_689  translin  26.63 
 
 
217 aa  69.7  3e-11  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  5.18414e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.63 
 
 
210 aa  69.3  3e-11  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.63 
 
 
222 aa  69.3  4e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.49 
 
 
217 aa  68.9  4e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  23.32 
 
 
231 aa  66.2  3e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  31.98 
 
 
197 aa  65.5  5e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.7 
 
 
208 aa  63.9  1e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0955582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>