38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0032 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 
252 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  95.24 
 
 
252 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  93.25 
 
 
252 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  90.87 
 
 
252 aa  441  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  73.41 
 
 
252 aa  361  6e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  53.6 
 
 
278 aa  254  6e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  51.6 
 
 
249 aa  244  1e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  51.39 
 
 
250 aa  243  1e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 
248 aa  239  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 
247 aa  235  4e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 
249 aa  235  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  2.13252e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  48.22 
 
 
251 aa  233  2e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  49.4 
 
 
250 aa  233  2e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  50.2 
 
 
253 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  3.96442e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  49.2 
 
 
253 aa  226  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  46.03 
 
 
248 aa  226  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  49 
 
 
247 aa  225  5e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  49.61 
 
 
285 aa  224  8e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  48.81 
 
 
249 aa  224  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  50.39 
 
 
278 aa  223  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  50.79 
 
 
281 aa  223  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  48.82 
 
 
284 aa  222  5e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  47.83 
 
 
267 aa  219  2e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  49 
 
 
247 aa  213  3e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.182582 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  45.2 
 
 
267 aa  199  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  45.06 
 
 
263 aa  194  8e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  1.65336e-09  unclonable  3.83631e-07 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  39.2 
 
 
254 aa  159  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  1.05309e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  41.27 
 
 
271 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  36.47 
 
 
387 aa  152  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  34.78 
 
 
397 aa  136  3e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  37.3 
 
 
363 aa  135  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  35.25 
 
 
372 aa  115  7e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  33.46 
 
 
363 aa  114  2e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  33.33 
 
 
206 aa  50.4  2e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.05367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  32.28 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  34.32 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  34.32 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  29.75 
 
 
208 aa  42.4  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>