More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0029 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 
161 aa  323  8e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  96.89 
 
 
161 aa  313  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  95.03 
 
 
161 aa  310  5e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  83.33 
 
 
162 aa  272  2e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  89.86 
 
 
160 aa  254  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  50.37 
 
 
141 aa  144  4e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  46.76 
 
 
159 aa  144  4e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  46.04 
 
 
160 aa  141  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  46.04 
 
 
158 aa  140  1e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  45.32 
 
 
158 aa  135  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  47.33 
 
 
140 aa  132  2e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  45.26 
 
 
140 aa  131  4e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  6.07429e-10  unclonable  3.87819e-07 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  45.14 
 
 
136 aa  131  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  45.93 
 
 
141 aa  130  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  43.94 
 
 
140 aa  125  2e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  43.94 
 
 
141 aa  124  8e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  46.09 
 
 
187 aa  123  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  42.36 
 
 
137 aa  123  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  43.07 
 
 
136 aa  122  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  45.83 
 
 
137 aa  120  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  8.0677e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  43.94 
 
 
151 aa  120  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  42.34 
 
 
137 aa  119  1e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  44.44 
 
 
137 aa  120  1e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  42.42 
 
 
131 aa  119  2e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  43.75 
 
 
139 aa  118  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  42.96 
 
 
140 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  38.03 
 
 
182 aa  112  2e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  42.34 
 
 
141 aa  112  2e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  39.42 
 
 
136 aa  105  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  38.46 
 
 
147 aa  104  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  36.24 
 
 
142 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  38.35 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  35.25 
 
 
163 aa  89  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  51.67 
 
 
88 aa  64.3  6e-10  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  51.67 
 
 
87 aa  63.5  1e-09  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  38.37 
 
 
92 aa  62.4  2e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  43.66 
 
 
92 aa  61.6  4e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  41.86 
 
 
92 aa  61.2  6e-09  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  41.67 
 
 
93 aa  60.8  8e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.03026e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  41.56 
 
 
92 aa  60.5  9e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  43.84 
 
 
94 aa  60.5  9e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 
94 aa  60.1  1e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  42.11 
 
 
93 aa  60.1  1e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
94 aa  59.3  2e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  43.55 
 
 
95 aa  59.7  2e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  49.12 
 
 
93 aa  58.5  3e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0300  ribosomal protein S19  40 
 
 
89 aa  58.5  3e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.373495  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  41.33 
 
 
90 aa  58.5  3e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  41.79 
 
 
89 aa  58.9  3e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  42.42 
 
 
87 aa  58.5  3e-08  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2077  30S ribosomal protein S19  43.33 
 
 
93 aa  58.5  4e-08  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  3.62901e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1700  30S ribosomal protein S19  43.33 
 
 
93 aa  58.5  4e-08  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  1.07992e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1871  30S ribosomal protein S19  43.33 
 
 
93 aa  58.5  4e-08  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  37.84 
 
 
90 aa  58.2  5e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.59778e-07  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  41.33 
 
 
94 aa  58.2  5e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.45132e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  40.85 
 
 
92 aa  58.2  5e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  43.55 
 
 
95 aa  58.2  5e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  4.85262e-06 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  44.07 
 
 
94 aa  58.2  5e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  42.42 
 
 
91 aa  58.2  5e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  40.85 
 
 
92 aa  58.2  5e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  40.85 
 
 
92 aa  58.2  5e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
93 aa  58.2  5e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  39.44 
 
 
92 aa  57.8  6e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0088  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 
93 aa  57.8  6e-08  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  39.44 
 
 
92 aa  57.8  6e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  39.44 
 
 
92 aa  57.8  7e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  39.44 
 
 
92 aa  57.8  7e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  41.43 
 
 
94 aa  57.8  7e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  38.37 
 
 
90 aa  57.8  7e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  45.61 
 
 
93 aa  57.8  7e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.77682e-06  hitchhiker  1.20384e-09 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  39.44 
 
 
92 aa  57.8  7e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  40.7 
 
 
93 aa  57.8  7e-08  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  38.46 
 
 
94 aa  57.4  8e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  35.23 
 
 
92 aa  57.4  8e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  40 
 
 
92 aa  57.4  9e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0608  30S ribosomal protein S19  42.65 
 
 
93 aa  57  9e-08  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0413  30S ribosomal protein S19  42.65 
 
 
93 aa  57  1e-07  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.360055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  45.61 
 
 
91 aa  57  1e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.39134e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  43.86 
 
 
93 aa  56.6  1e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.20025e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  41.43 
 
 
92 aa  57  1e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4919  ribosomal protein S19  41.94 
 
 
80 aa  57  1e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0706755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  39.44 
 
 
92 aa  57  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  41.86 
 
 
93 aa  56.6  2e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  1.50625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  41.67 
 
 
89 aa  56.6  2e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.59969e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  37.21 
 
 
93 aa  56.2  2e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.87656e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  35.96 
 
 
98 aa  56.2  2e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0270  ribosomal protein S19  44.93 
 
 
91 aa  56.2  2e-07  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  7.78686e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
95 aa  56.6  2e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0576  30S ribosomal protein S19  36.36 
 
 
92 aa  56.6  2e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  35.96 
 
 
98 aa  56.2  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  45.61 
 
 
91 aa  56.2  2e-07  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0763  30S ribosomal protein S19  33.72 
 
 
92 aa  56.2  2e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.039039  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  37.21 
 
 
93 aa  56.2  2e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39735e-15 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  41.86 
 
 
93 aa  56.2  2e-07  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  38.03 
 
 
92 aa  55.8  2e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  35.96 
 
 
98 aa  56.2  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  40.35 
 
 
92 aa  55.5  3e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  36.78 
 
 
96 aa  55.8  3e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  39.74 
 
 
94 aa  55.1  4e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  41.1 
 
 
95 aa  55.1  4e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>