More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0025 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  97.33 
 
 
450 aa  868  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 
450 aa  888  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  91.78 
 
 
450 aa  835  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  79.11 
 
 
450 aa  716  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  97.78 
 
 
450 aa  874  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  49.78 
 
 
439 aa  444  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  49.18 
 
 
443 aa  429  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  47.19 
 
 
437 aa  428  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  48.09 
 
 
446 aa  428  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  48.05 
 
 
443 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  48.72 
 
 
440 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  46.65 
 
 
444 aa  413  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  47.59 
 
 
449 aa  402  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.45882e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  46.96 
 
 
441 aa  395  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  43.11 
 
 
469 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.35 
 
 
446 aa  382  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.47 
 
 
464 aa  374  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  43.56 
 
 
433 aa  369  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  3.71893e-06 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.65 
 
 
464 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  45.76 
 
 
447 aa  368  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  44.24 
 
 
442 aa  367  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.59 
 
 
463 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.22 
 
 
468 aa  361  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.47 
 
 
431 aa  355  1e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  40.98 
 
 
433 aa  354  1e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  41.38 
 
 
433 aa  351  2e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  42.63 
 
 
431 aa  345  1e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  39.12 
 
 
449 aa  330  3e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  5.83511e-06  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  38.05 
 
 
513 aa  322  6e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.09 
 
 
481 aa  316  7e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  4.91114e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  41.2 
 
 
444 aa  314  3e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  40.09 
 
 
561 aa  312  8e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  39.32 
 
 
510 aa  308  1e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  40.86 
 
 
445 aa  307  2e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.88375e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  39.77 
 
 
433 aa  307  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  39.31 
 
 
433 aa  306  4e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.21808e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  39.5 
 
 
446 aa  305  9e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  8.59311e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  36.79 
 
 
441 aa  305  1e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.81 
 
 
447 aa  304  2e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.8858e-09  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  38.78 
 
 
443 aa  303  3e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.09658e-08  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  37.53 
 
 
542 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  38.77 
 
 
450 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  38.29 
 
 
520 aa  301  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  39.81 
 
 
446 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.40128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  36.26 
 
 
479 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.95 
 
 
449 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  5.14832e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.9 
 
 
446 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.41723e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  37.59 
 
 
448 aa  296  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  38.33 
 
 
444 aa  297  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  38.11 
 
 
444 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  37.72 
 
 
449 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  39.36 
 
 
591 aa  296  6e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  39.1 
 
 
450 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.92246e-06  unclonable  2.76763e-08 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  38.23 
 
 
492 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  38.23 
 
 
492 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  39.25 
 
 
449 aa  291  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  2.93601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  37.25 
 
 
521 aa  292  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  37.28 
 
 
449 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.80679e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  38.39 
 
 
453 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.77324e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  40.24 
 
 
452 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.16081e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  38.16 
 
 
453 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  3.27935e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  37.83 
 
 
512 aa  290  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  38.42 
 
 
443 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  38.12 
 
 
488 aa  290  5e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.7 
 
 
454 aa  289  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  40.14 
 
 
451 aa  289  7e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  38.15 
 
 
469 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.44 
 
 
496 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  37.93 
 
 
453 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.61 
 
 
490 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.66323e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  37.32 
 
 
446 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  6.90531e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  39.43 
 
 
467 aa  287  3e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  39.06 
 
 
449 aa  287  3e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  2.65163e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  38.78 
 
 
461 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.06608e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  39.43 
 
 
444 aa  286  6e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  6.02256e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  40.48 
 
 
446 aa  286  7e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  39.77 
 
 
435 aa  286  7e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.30095e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  36.01 
 
 
485 aa  285  1e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  37.27 
 
 
492 aa  285  1e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  37.59 
 
 
463 aa  285  1e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.52943e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  38.05 
 
 
449 aa  285  1e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  36.81 
 
 
447 aa  285  1e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  35.31 
 
 
449 aa  285  2e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.64274e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  39.9 
 
 
435 aa  285  2e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.2194e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  37.95 
 
 
443 aa  284  2e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.54 
 
 
443 aa  284  2e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.96 
 
 
452 aa  284  2e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.07321e-08  hitchhiker  1.41752e-06 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  37.1 
 
 
453 aa  284  3e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  9.44997e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  35.96 
 
 
444 aa  283  3e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  37.79 
 
 
449 aa  284  3e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.6406e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  37.79 
 
 
449 aa  283  4e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16729e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  37.79 
 
 
449 aa  283  4e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.28008e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  37.79 
 
 
449 aa  283  4e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.32061e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  37.79 
 
 
449 aa  283  4e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  37.79 
 
 
449 aa  283  4e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  3.47799e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  37.5 
 
 
449 aa  283  5e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.43009e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.71 
 
 
443 aa  282  7e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  37.56 
 
 
449 aa  282  8e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.57828e-07  unclonable  2.8199e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  37.96 
 
 
452 aa  282  8e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  37.56 
 
 
449 aa  282  8e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>