26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0005 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
331 aa  642  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  88.82 
 
 
314 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  86.58 
 
 
314 aa  516  1e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  67.73 
 
 
317 aa  405  1e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  46.69 
 
 
317 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  46.69 
 
 
317 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  45.08 
 
 
323 aa  283  2e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  26.14 
 
 
327 aa  111  1e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  24.22 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  23.73 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  23.33 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  26.91 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  24.19 
 
 
314 aa  85.5  1e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  22.94 
 
 
318 aa  82  1e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  23.27 
 
 
319 aa  78.2  2e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  25 
 
 
310 aa  74.3  2e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  25.37 
 
 
329 aa  71.6  2e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  21.51 
 
 
319 aa  67.4  3e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  23.83 
 
 
312 aa  63.9  3e-09  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  23.35 
 
 
323 aa  59.7  6e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0047  hypothetical protein  21.18 
 
 
302 aa  57.8  3e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.369746  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0110  hypothetical protein  23.83 
 
 
319 aa  56.6  5e-07  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  22.43 
 
 
378 aa  51.2  2e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  24.31 
 
 
316 aa  50.1  6e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  21.43 
 
 
362 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  18.61 
 
 
397 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>