65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0037 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0037  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.499961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  91.46 
 
 
86 bp  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0050  tRNA-Tyr  88.37 
 
 
86 bp  91.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11931  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  90.28 
 
 
83 bp  87.7  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.074992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0022  tRNA-Tyr  89.39 
 
 
86 bp  75.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0002  tRNA-Tyr  84.88 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0009  tRNA-Tyr  85.19 
 
 
86 bp  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193083  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0058  tRNA-Tyr  85.33 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  100 
 
 
84 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  100 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0048  tRNA-Tyr  83.72 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.012398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0059  tRNA-Tyr  100 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000803667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1903  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000431131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0009  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000816684  normal  0.0119926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0056  tRNA-Tyr  84 
 
 
86 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000675719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000509746  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0011  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000561505  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0405  tRNA-Tyr  83.13 
 
 
83 bp  54  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00881766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0061  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000782814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0028  tRNA-Tyr  92.11 
 
 
86 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000249872  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0022  tRNA-Tyr  92.11 
 
 
84 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4432900000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0054  tRNA-Tyr  92.11 
 
 
88 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000280744  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0023  tRNA-Tyr  92.11 
 
 
86 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0238179  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0014  tRNA-Tyr  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000194257  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0048  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0033  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000103069  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  96.43 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0016  tRNA-Tyr  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0163881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4565  tRNA-Tyr  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0035  tRNA-Tyr  88.37 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0015  tRNA-Tyr  88.37 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216156  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0035  tRNA-Tyr  88.37 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.641797  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0034  tRNA-Tyr  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0015  tRNA-Tyr  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0007  tRNA-Tyr  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000157532  hitchhiker  0.000000000121254 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1215  tRNA-Tyr  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0004  tRNA-Tyr  93.33 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216119  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0024  tRNA-Tyr  93.33 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0055  tRNA-Tyr  93.33 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000670702  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0011  tRNA-Tyr  93.33 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000214053  hitchhiker  0.00323075 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t09  tRNA-Tyr  93.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000014277  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>