More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3032 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  835    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  50.12 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  48.9 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  48.89 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  48.84 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 405 aa  359  7e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  48.26 
 
 		 412 aa  358  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  51.49 
 
 		 406 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  47.34 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  45.77 
 
 		 422 aa  332  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  47.29 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  46.86 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  45.81 
 
 		 406 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  43.11 
 
 		 428 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 419 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 421 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  48.55 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 406 aa  293  3e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  44.35 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  43.64 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  43.64 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  43.64 
 
 		 399 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  41.39 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  41.37 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0789  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 		 427 aa  235  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  38.21 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  36.8 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  33.07 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  33.66 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0271  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 429 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  32.98 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1794  multidrug resistance protein  37.4 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0121  multidrug resistance protein  37.4 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1708  multidrug resistance protein  37.4 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.477199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1119  multidrug resistance protein  37.4 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0305  multidrug resistance protein  37.4 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1290  multidrug resistance protein  37.4 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.800676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  32.14 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  32.42 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 412 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1444  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49750  MFS family transporter  40 
 
 		 422 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 411 aa  170  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 386 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  33.69 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.69 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 387 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 398 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.89 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  34.33 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 392 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  35.93 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 442 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1298  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.148337  normal  0.167522 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  33.82 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  30.05 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  28.81 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  35.9 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.32 
 
 		 422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 423 aa  136  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1788  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.48 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>