More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2952 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  61.5 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  57.34 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  57.6 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  55.5 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  56.05 
 
 		 230 aa  236  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  59 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  55.05 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  55.5 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  55.16 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  58.45 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  57.49 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  59.39 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  56.8 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  54.5 
 
 		 228 aa  225  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  53.62 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  56.7 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  54.59 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  57.07 
 
 		 242 aa  222  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  55.44 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  52.29 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  52.29 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  51.83 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  52.17 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  53.88 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  56.19 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  58.25 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  52.09 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  52.66 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  52.76 
 
 		 218 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  52.43 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  49.76 
 
 		 219 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  55.15 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  47.34 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  53 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  49.77 
 
 		 220 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  43.78 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  51.8 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  54.69 
 
 		 191 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  52.06 
 
 		 221 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  52.06 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  51.79 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  53.61 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  37.7 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  44.62 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  43.52 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  38.77 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  36.7 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  35.84 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  41.03 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.17 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  36.28 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  36.6 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  40.51 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  36.36 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  34.33 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  41.23 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  37.38 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  38.39 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  41.95 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  39.83 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  39.71 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  36.28 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  34.87 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  34.88 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  38.36 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  36.7 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  34.22 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  34.96 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  36.24 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  35.02 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  40.51 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  38.7 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  34.96 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  35.19 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  40.69 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  32.6 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  33.81 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  37.16 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  36.45 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  39.57 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  34.07 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  34.25 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  37.27 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  34.07 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  35.55 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  35.75 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  34.47 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  34.07 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  34.51 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  37.91 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  34.07 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  36.23 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  40.26 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  37.61 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  37.78 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  37.33 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>