More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2948 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  52.92 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  52.73 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  52.57 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  52.57 
 
 		 268 aa  292  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  51.84 
 
 		 268 aa  291  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  52.73 
 
 		 293 aa  291  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  51.84 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  52.55 
 
 		 270 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  53.45 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  51.09 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  52.55 
 
 		 352 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  52.79 
 
 		 268 aa  281  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  52.24 
 
 		 268 aa  278  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  52.73 
 
 		 269 aa  278  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  50.92 
 
 		 284 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  50.74 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  50.36 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  49.45 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 267 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  49.44 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  49.1 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  51.67 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  52.36 
 
 		 269 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  52 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  52 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  51.27 
 
 		 269 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  52.08 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  53.23 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  50.55 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  47.01 
 
 		 271 aa  248  9e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  48.47 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  49.07 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  48.33 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  48.7 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  49.08 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  48.7 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  48.69 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  48.7 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  49.15 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  39.78 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  37.59 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  34.67 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  36.16 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  34.44 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  36.43 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  34.81 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  35.04 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  30.43 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  33.58 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  32.97 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  34.43 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  34.18 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  35.19 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  31.75 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  31.75 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  32.97 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  32.36 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.04 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  36.2 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0371  exodeoxyribonuclease III  33.68 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.226435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  33.09 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  34.32 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  34.06 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  34.55 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  35.59 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  34.66 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  34.32 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  35.59 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  33.94 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  35.34 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  32.23 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  34.31 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  36.23 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  34.3 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  34.67 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  34.28 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  34.67 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  34.31 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  35.84 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  32.1 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  32.73 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  33.45 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  29.6 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  31.74 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  31.18 
 
 		 275 aa  131  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>