209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2912 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 179 aa  366  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  44.57 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  43.5 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  40.11 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  40 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  39.43 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  39.43 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  39.43 
 
 		 197 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  39.43 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  39.43 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  38.86 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  38.29 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  38.29 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  37.14 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  38.07 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  38.42 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  41.9 
 
 		 191 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  36.46 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  39.55 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  37.71 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  36.57 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  38.64 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  38.64 
 
 		 199 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  37.85 
 
 		 182 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  37.5 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  37.34 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  38.2 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  39.33 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  39.78 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  38.55 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  38.2 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  37.43 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  38.55 
 
 		 184 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  38.64 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  36.31 
 
 		 204 aa  99  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  38.33 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  36.26 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  30.68 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  36.22 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  34.57 
 
 		 177 aa  84.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  39.72 
 
 		 215 aa  84.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  37.11 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  36.6 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  33.88 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  34.57 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  29.61 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  31.22 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.23 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.47 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  31.79 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  30.72 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  36.23 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  33.72 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  30.32 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.7 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  26.71 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  29.63 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  27.65 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  26.12 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  28.68 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.09 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  29.77 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  29.78 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00469  2,5 RNA ligase  40 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  29.23 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.01 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  34.64 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  32.17 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  30.83 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  25.38 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  32.62 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.01 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  29.44 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1760  2'-5' RNA ligase  31.3 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.907021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  31.69 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  28.99 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  29.01 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  32.42 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>