More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2800 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
133 aa  264  4e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  54.24 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.59 
 
 
139 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.97 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.43 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.35 
 
 
139 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.54 
 
 
135 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.04 
 
 
151 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.74 
 
 
135 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.4 
 
 
135 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.8 
 
 
134 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.6 
 
 
135 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  61.18 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  51.61 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.94 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.53 
 
 
135 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.88 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.76 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.98 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.44 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.32 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.35 
 
 
134 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.35 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.64 
 
 
134 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.47 
 
 
87 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.37 
 
 
136 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.07 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.69 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.64 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.5 
 
 
132 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
139 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.98 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.68 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.17 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  34.68 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.07 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2200  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.59 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.87 
 
 
139 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.22 
 
 
139 aa  84  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.18 
 
 
134 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
133 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
133 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
133 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.27 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.6 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.4 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0975  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5412  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.61 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782662 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.29 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  40 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.45 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.45 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.78 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.45 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2300  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.09 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.349396  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0140  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.45 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3492  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.85 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0175018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1312  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.7 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0997664  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.86 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.3 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.3 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.3 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.3 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.3 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.3 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.3 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4874  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.85 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.51 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.48 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.86 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  33.85 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.22 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.61 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.45 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.22 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.5 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.77 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.77 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.77 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.25 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.04 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  38.02 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>